厌氧菌感染常常发生在先有血管或组织损伤的情况下﹐组织坏死或需氧菌感染使局部缺氧﹐有利于厌氧菌的生长繁殖﹐因此很多厌氧菌感染均系内生性。厌氧菌常与需氧菌一起形成混合性感染。故非芽孢性厌氧菌是条件性致病菌。最常见的致病非芽孢性厌氧菌是消化球菌属﹑消化链球菌属的种类﹑厌氧链球菌和脆弱拟杆菌等。
非芽孢性厌氧菌不形成芽孢﹐这点有别于肉毒杆菌﹑破伤风杆菌和难辨梭菌等厌氧芽孢杆菌(梭状芽孢杆菌)。非芽孢性厌氧菌正常情况下即存在于人的口腔﹑呼吸道﹑胃肠道和皮肤﹑阴道。其存在对人体有利﹐肠道内的厌氧菌可产生乙酸和酪酸﹐从而抑制致病菌(如绿脓杆菌)的生长。脆弱拟杆菌又能合成维生素K﹐供人利用。厌氧菌常与需氧菌混在一起﹐且厌氧菌占绝对优势﹐在牙龈和大肠内﹐厌氧菌和需氧菌正常的比例是1000﹕1﹐而在唾液﹑胃﹑小肠﹑阴道二者是10﹕1。
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