新型VIP-HESI离子源将4D-代谢组学、4D-脂质组学和小分子定量筛选工作流程的灵敏度提高了10倍以上;
数据库全新发布包含CCS值的代谢物数据库METLIN-4D;
数据处理软件集成了代谢物CCS值预测功能CCS-Predict Pro;
新款代谢组学软件MetaboScape 2022和TASQ 2022,支持引入CCS值信息的4D-代谢物鉴定流程,支持4D-脂质组学专用鉴定方法,减少脂质假阳性识别。
美国马萨诸塞州比尔里卡 ——2021年6月21日,布鲁克在其全球4D-Metabolomics™ eXceed 网络研讨会上发布了全新VIP-HESI离子源、TIMS CCS数据库——METLIN-4D、CCS-Predict Pro软件和MetaboScape 2022软件。
VIP-HESI离子源可以显著提高检测灵敏度。软件方面,提供新的集成软件工具CCS-Predict Pro,以增加4D-代谢组学和4D-脂质组学工作流程的数据可靠性。
可加热的VIP-HESI离子源可以发挥去溶剂作用,使灵敏度提高16倍,从而可以在所有小分子检测中实现全新应用。VIP-HESI源可以连接到timsTOF Pro 2平台,同时提高4D-代谢组学和4D-脂质组学的检测灵敏度。它还可以与布鲁克高性能的impact II QTOF MS系统兼容,以改进食品、环境、法医和制药应用中农药、药物和药物代谢物的定量分析,更高的灵敏度可检测低浓度污染物。
布鲁克的合作伙伴们使用碰撞截面积值(CCS)在4D-代谢组学方面取得了重大进展。其中,代谢组学METLIN数据库的创建者——美国Scripps研究所的Gary Siuzdak教授,使用TIMS/PASEF方法采集的准确的CCS值创建了METLIN-4D数据库。METLIN数据库是世界上最大的代谢组学数据库,包含超过50万种化合物的质谱谱图。随着METLIN-4D数据库的加入,timsTOF Pro系统上测量的CCS值将MS/MS谱图一块,用于代谢物鉴定,增加检测结果的可信度。这些CCS值将在所有timsTOF系列仪器上通用,以通过减少歧义来增加可信度,进而减少代谢物的错误鉴定。
布鲁克还介绍了CCS-Predict Pro软件,这是一款预测小分子代谢物CCS值的算法工具。CCS-Predict Pro为未知化合物提供了基于大规模CCS值的生物信息学数据。CCS-Predict Pro使用机器学习来识别代谢物可能的结构,包括暴露组学和药物代谢物分析。
所有4D-代谢物分析流程都可在更新的MetaboScape 2022软件中运行,该软件继续支持 CCS的工作流程。MetaboScape 2022 中包含4D-Lipidomics的进一步进展,以提供易于使用的脂质组学。MetaboScape 2022使用新方法显示了潜在的假阳性鉴定结果,其中CCS值和保留时间决定了基于MS/MS碎片化结果的鉴定是否符合脂质结构。这种采用正交脂质特征的方法可以提高结果的准确性,并可以更快地验证潜在的脂质生物标志物。
布鲁克还宣布将CCS值纳入TASQ 2022中,以便通过布鲁克TargetScreener定量工作流程对食品和环境样品中的污染物进行更准确的识别。这些工具的结合使得4D-脂质组学和4D-代谢组学在生物学和分子水平上研究更为便利,为研究人员提供更完整更全面的数据。
全球最大的TIMS CCS数据库 —— METLIN-4D
MetaboScape 2022是布鲁克针对代谢组学和脂质组学CCS值的一体化软件解决方案的最新版本,同时使用了最新的脂质标记建议。4D Kendrick质量缺陷分析与基于使用动态交叉验证的回归模型自动异常值检测相辅相成。基于数据库规则的注释工具进行注释的脂质将由根据3D超平面模型计算的预测CCS值自动评级。