相信大家对于转录组和蛋白组的数据上传方法都不陌生,转录组数据一般上传到NCBI网站,蛋白组学数据一般共享在proteomexchange网站,那代谢组的原始数据呢?传到哪里?如何上传?有哪些注意事项?今天就来为大家一一揭晓。
非靶代谢组原始数据上传到哪里?
MetaboLights，简称为MTBLS,是EMBL-EBI数据库的子库，该库跨技术、跨物种，涵盖了代谢物的结构、生物学作用、位置、浓度、参考谱图以及来自代谢实验的检测数据，是重要的代谢组学实验和衍生信息的数据库（网址：https://www.ebi.ac.uk/metabolights/）。MetaboLights是众多优质期刊推荐的代谢组学资料库。
代谢组原始数据如何上传?
01
注册账号并激活
登陆所填写的注册邮箱，
02
上传数据
①
②登录之后
③
④有2种选择“现在上传原始数据”和“延后上传原始数据”，若选择现在就上传数据，请按照下图操作；
⑤系统会自动生成一个项目，并配有独有的项目号MTBLSxxxx及网址链接，建议大家记录下来，后期可以用于文章写作或进行数据查看,我们的注册邮箱也会同步收到一封邮件,其中包含有本项目的项目号及网址链接。随后
⑥网站提供2种数据上传方式，AsperaUpload和PrivateFTP Upload，建议选择AsperaUpload，上传数据会更快；
⑦先
⑧弹出上传数据的选项框，选择要上传的数据，
⑨然后系统默认会用IBM插件上传数据，如下图所示，上传完成后拉到页面最下方，
⑩填写studydescription信息，包含keywords、title、summary等，并且需要根据实际情况选择是否有manuscript；
⑪接下来进入上面流程图中的最后一步：填写sample& assaydetails，请根据项目实际情况如实填写，如果是POS和NEG模式都采集了，请分别选positive建立一个assay，再选择negative建立一个assay；
⑫填写完成后
⑬Protocols包括样本收集、提取、色谱方法、质谱方法、数据转换、代谢物鉴定方法，请根据实际情况填写；
⑭填写实验对照样本及正式样本的名称，包含空白、QC、混样等；
⑮填写sampledetails里的内容，根据实际情况填写物种、样本类型等信息。如有其他factor，如性别、年龄、用药等，则可以根据实际情况
⑯接下来补充，需要根据实际情况填写仪器类型、仪器型号、数据采集极性、扫描范围、样本对应原始数据、对应derived数据等信息，填写完成后，
⑰进入Metaboliteannotation填写，有两种方式：可以选择upload上传系统能够自动识别的txt文件File:m_MTBLS4669_LC-MS_positive__metabolite_profiling_v2_maf.tsv，该文件可在本网页上download下来然后填写metabolitesidentification、massto charge（m/z）、retentiontime(RT)、Modification（adduct形式）、代谢物定量值等关键信息（该文件可通过EXCEL打开并进行编写）；也可以
⑱填写完后，
⑲核对已填写的信息，确认无误后，根据项目是否完成选择“Submitted”或者“InCuration”，之后
⑳
㉑最后，
㉒在“Validation”后显示绿色的对号时，说明数据上传成功了。
有哪些注意事项?
使用Google浏览器；
每一步信息按实际情况填写，网页会自动保存，最后会再次确定论文的相关信息；
install plugin插件安装对网络状态要求较高，小迈尝试了多次才成功，若想节省时间，可“翻墙”进行后续操作；
数据上传如遇报错，可选择上午10点、11点左右上传，速度会更快；
后记
代谢组学上传数据就是这么简单，是不是感觉离文章发表又近了一步？
学会了就快来试试吧！
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