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Nature Portfolio | 探究中国帕金森病人群的遗传“密码”

Illumina因美纳
2023.5.18

帕金森病(Parkinson’s disease, PD)是一种神经退行性疾病,主要表现为动作迟缓、肌肉僵硬、肢体震颤等症状,还会造成认知和精神障碍等,严重影响患者的生活质量。到2030年,中国的帕金森病患者人数预计将达到494万,占全球病例的一半。已有研究表明遗传因素是帕金森病发病的关键因素之一,但中国患病人群的遗传背景仍不清楚。

帕金森病是一种常见的神经退行性疾病。 图片来源:koto_feja/Getty

2023年2月,中南大学湘雅医院唐北沙团队联合西湖大学杨剑团队在npj Parkinson''s Disease上发表了一项研究1。该研究利用全基因组测序技术,首次针对大样本的中国帕金森病人群进行全基因组关联研究,绘制了中国患病人群的风险基因变异图谱,并建立了多基因风险预测模型,为中国帕金森病高危人群的早发现和早诊断提供了指导。

目前帕金森病的发病机制尚不清楚,衰老、遗传和环境因素被认为在发病过程中起着关键的作用。随着遗传因素的作用受到越来越多的关注,多个全基因组关联研究相继发表,已鉴定了80多个帕金森病风险基因位点,但它们的研究对象主要是欧洲血统人群。对于人口基数大且人口日趋老龄化的中国,帕金森病人群的遗传背景仍不清晰。

为了识别中国人群中与其相关的遗传变异,研究人员首先使用全基因组测序技术对1972例帕金森病患者和2478名无神经系统疾病的对照受试者进行了全基因组关联研究,然后采用多重PCR测序技术对8209例患者和9454名对照进行了验证研究。结果识别了1个新的风险基因变异、4个之前报道过的风险基因变异,以及3个在LRRK2基因编码区的风险基因变异,据此绘制了中国帕金森病人群易感基因变异谱。

在全基因组关联分析数据的基础上,研究人员对中国帕金森病人群遗传结构特征进行了分析,发现中国人群和欧洲血统人群的遗传特征既存在中等程度的相关性,也存在一定的差异性。进一步分析发现,帕金森病表型与身高、II型糖尿病、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮和 γ-谷氨酰转移酶水平等表型存在潜在遗传相关性。这些结果为该疾病的流行病学调查和病理生理机制研究提供了方向。此外,研究人员还利用中国人群的风险基因位点构建了多基因风险预测模型,并发现多基因风险评分高的人群的发病概率是风险评分低的3.9倍。这一发现为帕金森病高危人群的早期筛查和诊断提供了指导。

这项研究也存在一些局限,例如,每组有限的样本数导致很难发现更多新的风险基因位点,以及新鉴定的风险信号没有经过功能实验去进一步验证等。总体而言,该研究不仅探究了中国帕金森病的遗传因素特征,也提示了全基因组测序技术在提高对帕金森病遗传结构理解方面的应用潜力。

参考文献:

1. Pan, H., Liu, Z., Ma, J.et al. Genome-wide association study using whole-genome sequencing identifies risk loci for Parkinson''s disease in Chinese population.NPJ Parkinson''s dis.9, 22 (2023).

npj Parkinson''s Disease

DOI:10.1038/s41531-023-00456-6

↓中文内容仅供参考,一切内容以英文原版为准,

Genome-wide association study using whole-genome

sequencing identifies risk loci for Parkinson’s disease in Chinese population

本摘要基于npj Parkinson''s Disease于2023年2月9日发表的一篇论文“Genome-wide association study using whole-genome sequencing identifies risk loci for Parkinson’s disease in Chinese population”,特此感谢本专题以下合作机构:

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