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重磅!沃特世发布全新理念数据库 Natural Products Atlas

沃特世
2020.5.21

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天然产物其开发价值的多样性而不断受到人们的关注。然而,天然产物成分繁杂,结构多样,为其研究带来了很大困难。以往的天然产物定性研究,通常需要依赖数据库搜索。但是随着信息技术的不断发展,传统的设计理念已经越来越难满足“大数据智能化”时代人们的要求。

沃特世一直致力于数据库技术的革新,与国际顶尖的专家合作,不断引领数据库技术风潮。沃特世现隆重推出全新理念的天然产物数据库Natural Products Atlas。该数据库结合了天然产物大数据,智能化交互界面等诸多先进设计,真正实现了大数据时代数据库信息的万物互联

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现在,小编就带大家先睹为快Natural Products Atlas的创新理念!

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Natural Products Atlas集成了文献与专利报道的化合物信息基于分子网络与大数据互联技术,构建了化合物维度、化学簇维度、节点网络维度、全局大数据维度等不同维度的信息平台。通过交互技术,实现化合物信息任意维度的深度挖掘。

065c636ff29670d3c5ef01e3f38ee98d.pngA. 化合物维度界面

B. 化学簇维度界面,通过化合物结构相似度形成化学簇

C. 节点网络维度,通过化合相似度形成节点网络 

D. 全局大数据维度,将所有数据根据化学空间形成大数据网络


除了包含常规数据库中的化合物名称、分子式、结构等信息外,Natural Products Atlas还包含天然产物来源的分类学全合成路线分离路径等信息,并且支持不同维度和形式的搜索,因此结合全局大数据可进行样品信息的全局深度探索。

如下图所示,以亚结构吡啶进行搜索,在全局大数据维度看到标红色的圆即为含有亚结构吡啶的节点网络,可进一步探知含该亚结构的相应化学簇和化合物的信息。结合天然产物来源分类学信息,即可在全局大数据维度探索结构及分类学信息分布关系。

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Natural Products Atlas中每个化合物均含有文献来源信息,可看到原始分离路径、合成路线等信息,并且可一键直达原文献界面,省去天然产物研究大量繁琐的文献查阅工作。并且,其具有智能交互的“文献-化合物”检索功能。如下图所示,我们以作者Kerry McPhail为例进行搜索,即可看到作者在不同期刊上发表文章的统计,文章中发表的化合物会按照时间轴,分别显示分离及合成获得的化合物。用鼠标任意点击不同模块,即刻产生相关信息的动态交互变化。

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Natural Products Atlas是目前包含微生物化学成分最全的数据库,并且其可以嵌入沃特世特有软件UNIFI及Progenesis QI的流程,从而实现天然产物不同应用方向的智能分析流程。

作为云端大数据库,Natural Products Atlas将不断更新。除不断丰富化合物数量外,还将整合化合物红外、旋光度、NMR、生物活性、生物地理学等信息,从而构建形成天然产物全维度的智能大数据库

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想要了解更多Natural Products Atlas信息,

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为了帮助大家更好地了解该数据库,沃特世特邀Natural Products Atlas的设计者、国际知名专家Roger Linington教授,为我们带来网络讲座

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