景杰生物
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2021
!年度回顾
岁末又至,我们的年度盘点也如约而来
2021年,蛋白质组学
尤其是修饰组学研究依旧在蓬勃发展
在此,我们为大家汇总了
2021年度蛋白组学领域重要文章系列解读
以飨读者
继上一篇【肿瘤蛋白组学相关文章合集】后
本文我们汇编了【修饰组学相关文章合集】
修饰组学尤其是磷酸化修饰组
被广泛应用肿瘤领域大样本研究当中
在此我们精选了部分文章
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04. 个体化磷酸修饰组学,精准识别关键功能性磷酸化特征(Personalized phosphoproteomics identifies functional signaling)
发表期刊:Nature Biotechnology ( IF=54.91 )
发表时间:2021年12月2日
研究团队:澳大利亚科学院院士David E. James、Sean J. Humphrey以及丹麦哥本哈根大学 Jørgen F. P. Wojtaszewski
研究内容:该研究报道了一种个体化磷酸化修饰组技术方法,能够精确定位与感兴趣的生物过程相关的磷酸化。通过将受试者的表型差异与个体动态磷酸化修饰组关联起来,发现了诸多新的未被报道的关键功能性磷酸化位点,并揭示了主要代谢调节激酶mTORC1和AMPK之间以前未被报道的相互作用。此方法成功应用于研究运动和胰岛素对肌肉葡萄糖代谢的相互作用,揭示了运动如何增强人类骨骼肌中的胰岛素信号传导及其过程中的关键机制。
这种方法和思路,或可应用于与所关注的生物学问题相关的表型可与磷酸化蛋白质组同时测量的任何情况,在未来能够扩展到更大、更多样化的队列,特别是在癌症生物学与肿瘤分子分型研究中将发挥更大的作用。
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08. 琥珀酰化介导的肿瘤细胞氧化应激调控新机制(SUCLA2-coupled regulation of GLS succinylation and activity counteracts oxidative stress in tumor cells)
发表期刊:Molecular Cell (IF=17.97)
发表时间:2021年5月14日
研究团队:浙江大学转化医学研究院吕志民教授和中国海洋大学于日磊教授
研究内容:研究发现,在胰腺导管腺癌中呈现谷氨酰胺酶(GLS)高表达,相比于正常细胞,胰腺导管腺癌细胞的生长和存活对于谷氨酰胺代谢表现出更强的依赖性。重要的是,在GLS蛋白上也发现了琥珀酰化修饰,该修饰发生在K311位点,可由琥珀酰辅酶A直接介导。琥珀酰化修饰促进了GLS由单体向有活性的四聚体的转换,从而提高了其催化活性,增强了对谷氨酰胺的分解代谢。
该研究揭示了一个全新的GLS调节机制——琥珀酰化介导的GLS活性调控,并发现肿瘤细胞在氧化应激条件下,通过SUCLA2调控 GLS的琥珀酰化和酶活性,促进谷氨酰胺代谢,在细胞凋亡、肿瘤增殖中起重要作用。研究证实了GLS K311琥珀酰化与人PDAC的临床侵袭性相关,强调了干预GLS琥珀酰化对于癌症治疗策略的可能性。
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10. 新型组蛋白翻译后修饰——赖氨酸甲基丙烯酰化修饰(Histone lysine methacrylation is a dynamic posttranslational modification regulated by HAT1 and SIRT2)
发表期刊:Cell Discovery (IF=10.849)
发表时间:2021年12月28日
研究团队:芝加哥大学赵英明教授团队
研究内容:该研究报道了一种新型翻译后修饰——组蛋白赖氨酸甲基丙烯酰化(Kmea),并揭示了甲基丙烯酸酯是Kmea的代谢前体,HAT1、SIRT1和SIRT2分别是Kmea的writer和Eraser。研究使用泛Kmea抗体和质谱法在HeLa细胞中鉴定到27个Kmea修饰的组蛋白位点。
Kmea的发现为甲基丙烯酰辅酶A积累的病理作用提出了一种新的方向,为代谢和表观遗传调控之间的关联研究打开了一个新窗口。
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修饰组学文章合集
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