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植物生长专题 | 多组学研究在植物种子、根、茎、叶、花全生长周期中的应用

鹿明生物
2022.1.26

编者按

植物生长包括从生根、发芽到开花、结实和成熟等生命过程。植物如何平衡生长和响应胁迫,如何探究植物生长过程中的变化、如何进行环境污染物毒理学研究?本篇小编从植物生长的全周期过程用组学研究来探索植物每个生长阶段,这些研究将对于我们的育种改良,作物高产等有着至关重要的作用。下面跟着小鹿一起来看看吧~

01

植物种子相关研究

中文标题:基于iTRAQ蛋白质组学和转录组学联合分析揭示油茶种子成熟过程中油质相关的关键代谢产物的积累

研究对象:油茶种子

发表期刊:Horticulture Research

影响因子:6.793

发表时间:2021.07.01

发表单位:海南大学园艺园林学院

运用生物技术:RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学、转录组学、蛋白组学

文章中iTRAQ标记定量蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持

油茶的种子在成熟过程中会经历一系列复杂的生理生化变化,主要表现为某些与油质密切相关的代谢产物,特别是黄酮类和脂肪酸的积累和转化。2021年7月,海南大学园艺园林学院吴友根教授课题组等在《Horticulture Research》期刊发表的研究成果,通过RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法,发现了油茶种子成熟过程中与油质相关关键代谢产物的积累模式特征,探究了不同成熟度油茶转录组和蛋白质组谱机理,描绘了海南油茶种子成熟过程的动态变化图谱。为该树种的遗传改良提供了理论依据。

图 | 油茶种子中与类黄酮合成相关的生化途径图中蛋白质和转录组的表达

目前鹿明生物AB SCIEX-QTRAP-6500+液质联用平台黄酮酚类物质Kit包,13大类、130种黄酮酚类物质,4大优势,保证数据准确性。

02

植物根茎研究

中文标题:TNT、RDX、HMX(三种爆炸物)在苜蓿中的生物降解和植物毒性机制分析

研究对象:苜蓿根

发表期刊:Chemosphere

影响因子:7.086

发表时间:2021.05.18

合作单位:西南科技大学

运用关键技术:LC-MS非靶向代谢组学

文章中LC-MS非靶向代谢组学由欧易/鹿明生物提供技术支持

2021年5月,西南科技大学罗学刚教授团队在Chemosphere期刊发表的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,探索了爆炸物暴露对植物的毒性机制,验证了植物体内被降解的TNT、RDX 和 HMX残留物和中间产物干扰植物正常生理代谢的假设。描绘了在三种爆炸物影响下苜蓿代谢组图谱,为环境污染物毒理学研究提供了新思路和方法。

03

植物叶片研究

中文标题:干旱条件下木薯的转录组和蛋白质组联合分析揭示了广泛的转录后调控机理

研究对象:木薯叶片、根

发表期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry

影响因子:5.279

合作单位:中国植物基因研究中心

运用欧易/鹿明生物技术:转录组测序、iTRAQ标记定量蛋白质组学(由鹿明生物提供技术支持)

干旱是世界范围内严重影响植物生长和作物产量的非生物胁迫之一。植物对干旱胁迫具有复杂的调节机制,干旱引起多种生理生化变化。本文为中国植物基因研究中心课题组在Journal of Agricultural and Food Chemistry发表的研究成果,通过转录组测序技术和iTRAQ标记定量蛋白质组学联合研究,在木薯叶片和根中分别鉴定出1242/715个差异表达基因(DEGs)和237/307个差异表达蛋白(DEPs)。本研究作为木薯转录组学和蛋白质组学分析的首次研究,为干旱胁迫下木薯的转录后调控提供了新的方向。

04

植物成熟果实研究 

中文标题:利用BADH2新等位基因生产芳香三系杂交稻

研究对象:水稻

发表期刊:Plant Biotechnology Journal

影响因子:9.803

发表时间:2021.08.31

发表单位:中国水稻研究所

运用生物技术:GC-MS顶空代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、基因编辑技术

香味是决定稻米烹饪和食用特性的独特和关键指标之一。2021年8月,中国水稻研究所胡培松院士团队在Plant Biotechnology Journal期刊发表的研究成果,依靠GC-MS顶空代谢组学的平台对BADH2等位基因系成熟籽粒进行性状分析。研究新型BADH2等位基因生产芳香杂交水稻机理,加快了水稻品种香味研究改良进程。

 

鹿明生物顶空GC-MS代谢组学测定技术还可用于茶叶、花卉以及各种农产品中酚类、酯类、醇类等挥发类代谢物使挥发性物质成分检测。

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文末看点|lumingbio

本文小鹿盘点了植物的生长周期由种子-根/茎-叶/花-果实的全周期研究成果,其中运用了多组学研究技术更有助于全面的研究物种成长变化。长按扫描下方二维码获取文章原文或咨询欧易/鹿明生物技术工程师,回复您的样本咨询研究方案

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