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微生物专题 | 值得收藏!16S和宏基因组送样要求汇总

迈维代谢
2022.4.18

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 前言

随着高通量测序技术的快速发展,人们对微生物的认知也在逐渐深入。微生物测序在环境、医学、农业、工业等各领域都有广泛应用,样本种类繁多,上到高山之巅的土壤,下到海洋深处的底泥,既能研究其对环境变化的影响,又可探究动物体内生理代谢的奥秘。常用的微生物检测手段主要是16S/ITS/18S扩增子测序和宏基因组测序,充足的样本量是保证测序质量的第一步。


微生物样本类型多样,主要包括:粪便、肠道内容物、拭子、瘤胃液、发酵液、组织液、冲洗液、组织、血浆、鲜奶、酸奶、土壤、污泥、沉积物、腐殖质、水体滤膜、空气滤膜、食品表面拭子、食糜等。不同的样本类型需要的样本量有区别,同一样本类型不同测序策略需要的样本量也有差异。




16S/ITS/18S扩增子测序所需样本量如下:

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宏基因组测序所需样本量如下:

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注:

(1)以上送样量为参考量,实际以提取结果为准;

(2)DNA样本需客户提供电泳图;

(3)PCR产物要经过纯化(如胶回收纯化),PCR产物需带有双端 Barcode序列,需客户提供电泳图;

(4)特殊样品,请联系公司技术人员协商送样量。


总 结

合格的样本是准确获取样本微生物组数据的保障,是实验和项目顺利完成的基础。以上是迈维代谢根据已有项目经验制定的微生物组样本要求保障客户项目的顺利开展


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