新鲜出炉！12组空间代谢组学常见问答来了，快来get吧~

A: AFADESI-MSI的空间分辨率（即一个像素点的尺寸大小）目前常用的有100um*100um，40um*40um，20um*20um，我们要根据自己关注的组织微区大小去选择合适的分辨率。

A: 空间代谢组与常规代谢组对于代谢物的定性需要通过与数据库匹配来获得定性信息。鹿明生物拥有2个空间代谢组自建库，包涵胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多个种类代谢物；

另一个专门针对植物的空间代谢自建库，目前拥有涵盖生物碱类、酚酸类、黄酮类、香豆素类、苯丙素类、木脂素、萜类等10大类代谢物。

数据库的建设经过文献、公共数据库、标准品、人工校对等去增加定性的可靠性。

A: 大/小鼠的生物学重复建议≥3个，大型动物的生物学重复建议≥5个，临床样本的生物学重复建议≥5个。 

A: 通过空间代谢组获得的成像图找到具有异质性分布的代谢物，并结合统计学分析和通路富集分析等进一步确认自己的目标代谢物。

可以通过原位二级对代谢物定性信息进行验证后，利用IHC、WB、PRM等手段对关键的酶进行鉴定。 

A: 1）医学领域

A: 2）农林牧渔领域

• 发育学

如种子、胚胎、器官发育过程中的空间代谢调控等；

• 分子机制

如盐胁迫、病毒/真菌侵染、光合作用等机制研究；

• 基因调控机制

如转基因、基因沉默、基因敲除后代谢物变化的机制研究，了解基因与代谢物之间的精确关系等；

•植物与环境互作研究

如昆虫选择性侵害植物部位、土壤与根部互作研究等；

• 植物药用成分定位；

A: 两个都重要。空间分辨率并非越高越好，要选择能够满足自己研究目的，经费上又可控的空间分辨率。

空间代谢组主要解决的是代谢物的空间定位问题，通过非靶向的方式获得具有空间异质性分布的m/z，后续针对目标m/z通过原位二级进行验证。

A: 鹿明生物的AFADESI-MSI空间代谢组技术是专门针对小分子代谢物的成像技术，聚焦在70-1000Da之间的物质检测，不能检测蛋白或者多肽，但是可以无偏向性的检测小分子代谢物。

A: 是的，通过HE染色。做空间代谢组学，在上机前，我们都会对一张切片进行HE染色，确定了结构后才会将连续切片上机进行扫描以及后续的分析。

另外对于肿瘤组织做空间代谢组，无需将癌和癌旁分割后再送样，可以利用空间代谢组对一整块的组织（包括癌和癌旁）实现同时成像。

A: AFADESI-MSI的空间分辨率（即一个像素点的尺寸大小）目前有100um*100um，40um*40um，20um*20um。对于一些较大的细胞，较高的分辨率可以到单细胞的水平，但是对于一些只有几um的细胞，就到不了单细胞水平了。

A: 无论是动物的还是植物的空间代谢组学，定性都是需要基于数据库。鹿明生物现在有两个自建空代数据库，一个专门针对人和动物，一个专门针对植物。

植物空代数据库涵盖生物碱类、酚酸类、黄酮类、香豆素类、苯丙素类、木脂素、萜类等10大类代谢物，次生代谢物占绝大部分。

A: AFADESI-MSI与MALDI平台最大的不同就是检测的物质类型不同。鹿明的空间代谢组平台聚焦在小分子代谢物的成像上，无偏向性检测小分子代谢物，主要检测的是70-1000Da之间的代谢物，包括胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等。其中，70%为700Da以下的小分子代谢物，30%为脂质类物质。

AFADESI-MSI的成像不借助基质喷涂，避免代谢物检测受到基质的干扰，可以对小体积的样本甚至整只小/大鼠的切片进行空间成像。

➧2023空间代谢组技术与实践培训班

鹿明生物提供优质的空间代谢组服务

空代仪器平台

项目执行

定性算法经过多维校准

项目实测结果