超实用工具 | 代谢组学MetaboAnalyst 5.0通路富集分析

通过代谢组学筛选到差异代谢物后如何进行通路分析，代谢组学在线免费通路富集分析工具最新版MetaboAnalyst 5.0，登录在线网址：https://www.metaboanalyst.ca/MetaboAnalyst/home.xhtml一站式完成。

Step. 1

登录Home首页点击Click here to start

Step. 2

点击 Pathway Analysis

Step. 3

步骤3可根据筛选到的差异代谢物选择Compound Name, KEGG ID, HMDB ID号，三选一即可，本流程以选择输入类型为化合物名称(Compound Name)进行通路富集分析作示例，复制代谢物名称到如下步骤4的空白处后点击Submit。

Step. 4

第1列物质名称为黄色表示未被数据库匹配的物质，详细情况可点击view一一查看，判断其代谢物别名是否与您输入的差异物名称匹配，此步也可借助HMDB等数据库作为辅助判断，如果步骤4输入的是KEGG ID或HMDB ID号通常不会出现类似问题。第1列为物质名称，第2列hit表示能匹配上的物质名称，第3-5列代表在不同数据库中的ID号。

Step. 5

判定匹配的物质名称前勾选上，并点击OK即可。

Step. 6

全部黄色的物质View完毕后点击Proceed。

Step. 7

下图步骤9的Hypergeometric Test(超几何分布)与Fisher''s Exact Test(费歇尔精确检验) 结果差距不大，此步通常默认参数即可；步骤10根据检测样品信息选择相应物种的数据库，以人Homo sapiens(KEGG) 示例下拉点击Proceed。

Step. 8

点击你所需要的通路名称，只有您点击通路名称后相应通路图才会包含在最后下载的压缩包中，建议点击Match Status列前面的数字＞2或p<0.05的通路名称，点击最后一列的KEGG可显示相应通路图。

Step. 9

如需生成TIFF或PDF等指定格式的通路富集分析图请执行步骤12和13操作，如对格式无特殊要求可忽略该步骤。

Step. 10

执行下图A-B-C操作点击Download下载即可保存分析结果。

Step. 11

压缩包结果文件说明

MetaboAnalyst 5.0作为代谢组学通用免费通路富集分析工具，深受代谢组学用户认可，你学会了吗？在使用中如有问题欢迎垂询400-867-2686，与我们一起探讨。