华大智造于2023年4月25日举行了第三期DNBSEQ-G99线上分享会:争分夺秒,全面提高病原微生物检测时效性——宏基因组病原微生物检测专场。
会议上,诺唯赞产品经理刘辉辉进行了“mNGS解决方案及G99测试分享”的报告。报告中提到,诺唯赞近期在华大智造DNBSEQ-G99及MGISEQ-2000测序平台上进行了转座酶法文库的测评。本次测评从测序质量、微生物检出情况等多方面客观地评估了诺唯赞转座酶DNA文库和转座酶RNA文库在华大智造测序平台上的的表现:
测序质量优异,Q30均达90%以上
灵敏度高,微生物DNA和RNA在1/10000掺比下均能有效检出
测评结果表现优异,一致性好。
此外,华大智造的新款基因测序仪DNBSEQ-G99速度优势突出,本次测试中, 使用SE50测序读长,3.5h内即可完成测序,联合诺唯赞转座酶建库方法,DNA建库1.3h,RNA建库只需2h,全面提升实验效率,灵活掌控实验节奏。
文库构建:
TruePrep DNA Flexible Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #TD504)
TruePrep RNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #TR501/TR502/TR503)
测序平台:
华大智造DNBSEQ-G99和MGISEQ-2000
诺唯赞基于TruePrep DNA Flexible Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #TD504)和TruePrep RNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #TR501/TR502/TR503)分别构建了模拟感染样本的转座酶DNA文库(293细胞gDNA模拟宿主核酸背景且分别掺入不同比例的Zymo #D6322微生物DNA标准品)和转座酶RNA文库(293细胞Total RNA模拟宿主核酸背景且分别掺入不同比例的微生物RNA),这两种文库下文中以微生物DNA文库和微生物RNA文库简述。
使用华大智造MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序仪对构建好的微生物DNA文库和微生物RNA文库进行测序。
表1. 微生物DNA文库构建方案
注:Zymo #D6322由2%的Sac. cerevisiae和均占比14%的Staphylococcus aureus、Escherichia coli、Listeria monocytogenes、Pseudomonas aeruginosa、Enterococcus faecalis、Salmonella enterica、Bacillus subtilis共计8种微生物DNA组成
表2. 微生物RNA文库构建方案
1、测序数据质量表现优异
微生物DNA文库和微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的数据质量好,Clean Q30均能达到90%以上。
图1. 微生物DNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的数据质量
图2. 微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的数据质量
2、微生物检出灵敏
微生物DNA和微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下的微生物检出reads数与实际掺入基本一致,两测序仪器对微生物DNA和微生物RNA在1/10000掺比下均能有效检出。
MGISEQ-2000
DNBSEQ-G99
图3. 微生物DNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下微生物检出情况
MGISEQ-2000
DNBSEQ-G99
图4. 微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99测序下微生物检出情况
Vazyme #TD504构建出的微生物DNA文库和Vazyme #TR501/TR502/TR503构建出的微生物RNA文库在MGISEQ-2000和DNBSEQ-G99两款测序仪器上均能实现微生物1/10000掺比下的灵敏检出,并且文库测序数据表现优异。
产品介绍
基因测序仪DNBSEQ-G99
华大智造的DNBSEQ-G99被称为“速度王者”,PE150测序仅需12个小时,SE100测序5个小时内即可完成。同时,G99也极具简单性和灵活性,双载台设置、双模运行模式、全新的卡式测序载片和一体化的测序试剂盒,可全面解放双手,为客户带来更佳测序体验。
诺唯赞转座酶建库解决方案
诺唯赞致力于提出更专业的产品与解决方案,为助力mNGS检测推出转座酶DNA Flex建库试剂盒(Vazyme #TD504)和转座酶RNA建库试剂盒(Vazyme #TR501/TR502/TR503),让建库更快速、更稳定、更准确。
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