科研必备，代谢组学双平台LC-MS+GC-MS技术；6大质控、5大数据库、多项分析层层助力高分好文

LC-MS和GC-MS技术是目前代谢组学研究常用的两大技术平台，GC-MS会更适用于分子量小，易挥发性的化合物，而LC-MS适用于极性强的化合物和中等极性的化合物，所以两大平台对于物质检测都有一定的局限性和偏向性。鹿明生物搭建LC-MS+GC-MS双平台解决这一卡脖子问题，代谢物的检出量得到显著提升，实现了强极性+弱极性代谢物全覆盖。究竟有哪些具体内容呢，跟着小鹿一起来看看吧。

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全流程6大质控 为数据保驾护航

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标准化数据库 为定性添砖加瓦

（1）LC-MS数据库-EMDB数据库：针对人、动物内源性代谢物建立的专属质谱数据库，包含标准品数据库和人工校对数据库，内源性小分子标准品库容量2500个，总库容量10000个。主要包括氨基酸及其衍生物、有机酸及其衍生物、碳水化合物及衍生物、有机杂环类、核苷类及衍生物、吲哚类及其衍生物、类固醇及衍生物、胆汁酸及衍生物、酰基肉碱类、溶血磷脂类、苯类及暴露组相关的等共计13大类代谢物，涵盖糖酵解/糖异生、TCA循环、苯丙氨酸代谢、色氨酸代谢、类固醇生物合成、类固醇激素生物合成、初级胆汁酸生物合成、甘油磷脂代谢等几十余条重要代谢通路。

（2）GC-MS数据库-LUG 4.0：具有自主知识产权的GC-MS数据库—LUG 4.0（Untarget database of GC-MS from Lumingbio，Version 4.0），专利号：ZL202010401911.0，内源性小分子标准品库容量1500个，总库容量3000个。覆盖了包括脂类、氨基酸、脂肪酸、胺类、醇类、糖类、氨基糖类、糖醇类、糖酸类、有机磷酸盐类、羟基酸类、芳香类、嘌呤类和甾醇类等多种物质。LUG数据库中的代谢物含有HMDB, KEGG, CAS识别号、物质分类等内容，信息更全面，方便后续进行代谢物功能研究

（3）商业及其他公共库已更新至最新版本：

A：最新HMDB 5.0版本（含有132335种代谢途径，覆盖了136878种代谢物或外源性物质）

B：最新METLIN数据库（包含85,000个代谢物标准MS/MS图谱）

C：Lipidmaps 数据库（收录超过8大类、4万种脂质，300种亚类、170万种脂质分子的MS2 & MS3数据库；）

（4）自建库所有标品均在自己仪器上建立，非外买库。样本实际检测所用液相、色谱柱、质谱仪、参数与自建库建立时完全一致，有效保证样本检测结果与自建数据库图谱的可比性以及数据准确性

（5）搜库方式升级：自建库中所有代谢物均包含保留时间信息，搜库采用保留时间+标准质谱图匹配（代谢物鉴定金标准），定性更准确；

图1 | 不同数据库搜库匹配实例

（注：上图为通过不同数据库及不同搜库方式得到的定性结果，通过实际的匹配情况及得分情况，可以发现通过保留时间及标准质谱图匹配可靠性最高）

（6）代谢物信息更丰富：提供保留时间、一级精确质量信息、二级质谱碎片信息、代谢物分类信息、分子量、分子式、CAS号、主流数据库ID编号（HMDB编号、METLIN编号、LIPIDMAPS编号、Pubchem编号）、KEGG号、InChIKey，方便研究者对代谢物进行信息溯源。

（7）聚焦功能代谢组：LUG4.0和EMDB2.0全面覆盖糖酵解/糖异生、TCA循环、苯丙氨酸代谢、色氨酸代谢、类固醇生物合成、类固醇激素生物合成、初级胆汁酸生物合成、甘油磷脂代谢等几十余条重要代谢通路。

图2 | 部分重要通路标准品覆盖情况

TOP级期刊生信分析：

A.基础分析：本套分析实现从海量的数据中筛选出关键代谢物及代谢通路，深度解析生理病理调控过程，解释生物过程的复杂性和整体性。

图3 | 标准分析内容

B.个性化分析：结合临床表型等指标，深度数据挖掘，从“因”和“果”两个层面来探究生物学问题，提升研究的完整性、广度和深度。

图4 | 机器学习标志物筛选

图5 | 部分高级分析

C.多组学联合分析：进行KEGG和相关性分析，从直接关联和间接关联两个维度，多角度挖掘重要基因、代谢物和通路。

图6 | 联合分析部分内容

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