技术简介:
数字基因表达谱(DGE)是研究某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况,全面、经济、快速地检测不同材料间的差异表达基因。
生物信息分析:
1. 基因表达量的分布情况
2. 库容量饱和度分析
3. 基因在样品差异表达分析
4. 样品可重复性分析
5. 基因在正义链和反义链上表达量间的关系
6. 对已注释表达标签和未注释表达标签统计
技术优势:
1、全基因组表达谱测序:不需要基于已知序列信息设计探针。
2、准确性高:可准确定量跨越6个数量级以上的转录本。
3、对任意物种基因表达谱分析:寻找不用样本之间的差异表达。
送样要求:
样品 | 要求 |
RNA | 去蛋白并进行DNase 处理后的完整总RNA |
组织 | 液氮处理,植物 ≥20ug ;动物 ≥5ug ;也可液氮研磨成粉末后加入Trizol(50-100mg 加入1ml Trizol );全血样品需新鲜样品时加入3 倍体积Trizol LS ,以防止RNA 降解。 |
浓度 | ≥200ng/ul |
纯度 | OD 260/280 =1.8~2.2 ;RIN ≥7 |