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面议
脱靶分析-GUIDE-seq
产品属性
品牌
舒桐生物
产地
广州
型号
脱靶分析-GUIDE-seq
关注度
0
信息完整度
关闭
产地:广州; 品牌:舒桐生物
珠海舒桐医疗科技有限公司
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CRISPR-Cas9基因定点敲入/点突变细胞系
产品描述
GUIDE-Pro
体内脱靶检测及高通量筛选有效
sgRNA
自
2013
年初发现
CRISPR-Cas9
在细胞内实现
DNA
精确编辑开始,该技术近年呈井喷式发展。相对于
ZFN
、
TALEN
等基因编辑技术来说,其更加简单、经济、容易操作,一般的实验室都可以构建自己的平台。令其成为迄今为止最为有效、低廉和容易的基因编辑方法。但目前
CRISPR/Cas9
的应用主要面临两大问题:其一是存在脱靶效应,严重影响了其临床应用;其二是
sgRNA
设计软件种类繁多,各有优劣。软件设计出的
sgRNA
需要进一步进行实验筛选,浪费了大量时间和金钱。
基于此,我们开发了一种高通量的、高敏感性和特异性的、同时检测切割效率和脱靶效应的有效
sgRNA
筛选方法
——GUIDE-Pro
。是基因编辑研究中不可或缺的脱靶检测方法,也是广大科研人员进行
sgRNA
筛选的利器。
相关链接:
舒桐生物科技有限公司 (generulor.com)
脱靶检测原理及实验流程
舒桐升级版
GUIDE- Pro
优势
直接在活细胞体内进行检测,切割效率和脱靶效应更加符合实际;
更高的敏感性及特异性;
更高的性价比:常用于基因编辑实验中有效
sgRNA
的筛选,同时获得不同
sgRNA
的在靶和脱靶数据,为后续实验提供有效支撑,大大降低后续实验及时间成本
;
更高的灵活性:除了
CRISPR/Cas9
,同时我们也成功开发了针对
TALEN
及
ZFN
的脱靶检测技术及分析流程;
更短的服务周期:从准备细胞到最终可视化结果呈现,仅需半月。
舒桐升级版
GUIDE-Pro
的应用场景
设计多条
sgRNA
后,利用
GUIDE-Pro
筛选切割效果最高,或者脱靶最低的
sgRNA
;无需再进行传统的耗时耗力的低通量筛选验证;
针对前期实验已经获得的有切割能力的
sgRNA
,需要进一步明确其体内脱靶效应;
基因编辑治疗过程中治疗效果及脱靶效应的检测。
实验示例:
GUIDE-Pro VS. GUIDE-seq
我们通过检测相同位点在相同数据量条件下的脱靶,结果显示:升级版
GUIDE-seq
的在靶
reads
数更高(
≥1
倍),脱靶
reads
数也提高了
≥4
倍。更为重要的是,
GUIDE-Pro
可以找到更多的脱靶位点。大大的提高了脱靶检测的敏感性和特异性。
相较于传统
GUIDE-seq
,本公司研发的
GUIDE-Pro
技术性价比极高。常用于基因编辑实验中有效
sgRNA
的筛选,同时获得不同
sgRNA
的在靶和脱靶数据。为后续实验提供有效支撑,大大降低后续实验及时间成本。
成功开发了
TALEN
及
ZFN
脱靶检测流程:目前全国乃至全世界均无有效的检测
TALEN
及
ZFN
基因编辑方法的检测手段,我们通过对实验及分析流程的不断改进,成功开发了针对
TALEN
及
ZFN
的检测方法。
服务内容
服务项目
内容
周期
交付形式
GUIDE-Pro
sgRNA
质粒构建+建库+测序+分析
20-30
个工作日
sgRNA
质粒+原始数据+可视化结题报告
样品要求
可提供目标基因序列,由我公司免费设计
sgRNA
;
或由客户仅需提供
sgRNA
序列,由我公司构建
sgRNA
质粒。或者提供
sgRNA
质粒即可,由我公司进行转染及后续建库测序;实验用细胞系由客户提供;
若提供电转后的
DNA
,则需要
DNA
样品总量:
5ug
以上,浓度
50ng/ul
以上。
DNA
样品纯度:
OD260/280=1.8~2.0
。
DNA
样品完整性:
DNA
无明显降解,需提供凝胶电泳检测胶图。
客户需检测
ODN
是否插入,若需我公司完成则需提供靶点信息
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