本方案采用比较基因组学和差异表达基因的启动子区序列转录因子结合位点探测技术相结合,共同构建调控网络。首先,我们从UCSC数据库获得差异表达基因的启动子序列(TSS-转录起始位点上游至下游范围),分别进行(1)启动子区序列分析(Motif探测,既转录因子结合位点预测),以及(2)8种脊椎动物全基因组比,计算启动子序列区域的保守性。
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