RSAM-16 可变聚腺苷酸化(APA)分析

本项目是对可变聚腺苷酸化（APA－Alternative polyadenylation）现象进行深度解析。

APA模式分析包括:

• (1) 对转录组3UTR分析进行测序，鉴定统计3UTR区域覆盖度；长度分布，以及3UTR上下游结构序列
• (2) APA模式分析：鉴定4种APA类型
• • Tandem 3 untranslated region (UTR) APA,
  • alternative terminal exon APA;
  • intronic APA
  • internal exon APA；
• (3) APA偏好性分析：近端与远端ploy(A)位点在样本中的偏好性；统计APA类型对应的频度
• (4) APA模式差异分析：比较样本之间的APA差异模式;
• (5) APA模式与表达量差异的关系;
• (6) PAS分析；
• (7) APA位点Motif分析；分析APA上下游Motif结构；
• (8) APA保守型分析：对APA位点进行跨物种比较基因组学分析。

更多详情：http://www.biogenius.cn/htm/products/transcriptome/rnaseq/analysis/316.html


 

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