疾病文本挖掘服务项目
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产品描述
     
      利用NLP(Natural Language Processing)方法从PubMed文献摘要数据库中分析A(某疾病)相关基因/蛋白。建立A相关基因/蛋白列表与基因/蛋白调节网络。将NLP挖掘出的与A相关的基因/蛋白进行功能性分析(KO、GO分析等),以寻找已知基因/蛋白的未知功能。
该平台用途相当广泛,例如:
1、可以对研究的相关领域有一个宏观了解;
2、有助于提高各类科学基金申请的成功率;
3、分析的基因一般都是专业的明星分子,在microRNA靶基因分析中,把这些分子做为microRNA的靶基因,是非常好的选择;
4、构建一个宏观的分子线路图,适用于信号通路分析类文章和综述类文章;
5、分析了低通量筛选出来的基因,可以用于和芯片、solexa等数据分析的比较;
6、通过构建基因调控网络,可以揭示目标基因之间的相互作用关系;
 
从PubMed中查找到与A相关的文献一共有n篇,n需达到可以构建基因/蛋白网络图标准。
 
基本流程
1)  文档搜索及格式化,利用关键词进行文档搜索,并将文档整理成XML格式。
2)  利用ABNER软件进行基因的描述的定位。
3)  基因符号以NCBI的entrez gene数据库为准。
4)  对于每个基因,统计该基因出现的频率。
5)  利用关键词搜索(X or Y),获得 n 篇相关文献。
 
详情查看:
    http://www.sensichip.com.cn/NLP_project.html
     联系方式:电话******nbsp; QQ:2696224254
               手机******Email: market@sensichip.com.cn
上海敏芯信息科技有限公司
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公司简介: 
上海敏芯信息科技有限公司是一家专业从事生物医学的科研服务型企业,成立有三年时间。
公司从基因组学,蛋白质组学及代谢组学各个方面均塔建了很好的平台,合作客户包括多位院士,与客户发表了多篇SCI文章,其中六分以上三篇。

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