该技术是一种全新的鉴定5hmC的方法。DNA脱氨酶APOBEC3A(A3A)能够特异地脱去C及5mC的氨基使其变为U,而5hmC
则因为不被该酶识别,测序时仍被识别为C。该技术利用该酶的这种特性,特异性地检测基因组上发生的5hmC修饰。
ACE-seq原理示意如下:
(1)利用β-葡糖基转移酶(βGT)将5hmC加上葡糖基,转变成5ghmC,5ghmC不会被A3A酶脱氨基。
(2)利用A3A酶特异去除C和5mC的氨基,使其转变成U,而5hmC保持为C,从而将5hmC和C/5mC区分开来。