ACE-seq技术特点

【技术特点】-- ACE-seq

该技术是一种全新的鉴定5hmC的方法。DNA脱氨酶APOBEC3A(A3A)能够特异地脱去C及5mC的氨基使其变为U，而5hmC

则因为不被该酶识别，测序时仍被识别为C。该技术利用该酶的这种特性，特异性地检测基因组上发生的5hmC修饰。

ACE-seq原理示意如下：

（1）利用β-葡糖基转移酶（βGT）将5hmC加上葡糖基，转变成5ghmC，5ghmC不会被A3A酶脱氨基。

（2）利用A3A酶特异去除C和5mC的氨基，使其转变成U，而5hmC保持为C，从而将5hmC和C/5mC区分开来。

技术优势：

实验策略

信息分析

技术参数

研究案例

开发了ACE-Seq技术并利用ACE-Seq探究小鼠脑部神经细胞5mC及5hmC的特征及作用

Nondestructive, base-resolution sequencing of 5-hydroxymethylcytosine using a DNA deaminase

1、背景：传统的鉴定5hmC的技术需要运用化学试剂进行转化，会破坏基因组DNA，且需要的DNA起始量较大。建立一种非破坏性的、低起始DNA量的鉴定5hmC的技术有助于加快加深5hmC的研究。

2、方法：利用DNA脱氨酶APOBEC3A(A3A)特异性脱去C及5mC的氨基使其转变成U的特性，建立了一种新型的鉴定基因组上的5hmC修饰的技术，并将该技术结合BS-Seq技术，研究了小鼠脑部神经细胞5mC及5hmC的特征及作用。

3、结论：分析了小鼠脑部神经细胞5mC及5hmC在不同基因元件的水平；探究了小鼠脑部神经细胞5mC及5hmC的异质性。探究了5mC及5hmC在小鼠脑部神经细胞中的作用。

【技术特点对用户带来的好处】-- ACE-seq

【典型应用举例】-- ACE-seq