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武汉植物园在高羊茅耐高温功能性状关联分析中取得新进展

2015.5.12
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Sabrina_刘

致力于为分析测试行业奉献终身

  高羊茅(Festuca arundinacea)又名苇状羊茅,隶属禾本科,是主要的冷季型牧草和草坪草,是我国使用量增长最快的优良草种,在我国北部及长江流域气候过渡区广泛建植应用。高羊茅地上部最适宜生长温度是15-24℃,根系为10-18℃。近年来我国一些地区夏季经常出现异常高温天气,极端温度达到40℃以上,且持续时间较长,导致高羊茅观赏品质和使用价值降低,甚至死亡。高温胁迫已成为高羊茅在我国南方地区发展的主要限制因子。

  中国科学院武汉植物园草坪种质资源学学科组孙小艳在研究员傅金民的指导下,以课题组收集的100份来源于33个国家地区的高羊茅种质材料,在武汉夏季进行两轮高温处理,对每份基因型材料的生长速率(GR),草坪质量(TQ),存活率(SR),叶绿素含量(CHL),蒸腾速率(ET)进行实时采集,构建高羊茅耐高温功能性状数据库。并利用SSR标记技术完成了高羊茅群体结构分析和耐热性状关联分析。结果表明5个功能性状GR,TQ,SR,CHL和ET在高羊茅基因型间呈现显著遗传多样性。从200对高羊茅EST-SSR标记中筛选出100对多态性标记,连接上FAM、HEX、ROX和TAMRA等荧光基团,利用ABI 3730测序仪进行SSR位点检测,用Structure软件对100份高羊茅进行群体结构分析,用Structure 2.2软件的分群结果,在P<0.001的水平下将分1-3群的关联分析结构的Q值分别做关联分析。群体结构分析结果表明k=3时分群结果最佳。G1类群是最大的类群,包括91份高羊茅材料(包括23个商业品种和68份野生品种)。G2类群包括21个野生高羊茅材料,大部分来源于亚洲地区,G3类群最小,包含8份材料,其中5个野生高羊茅材料来源于非洲。基于Q + K混合模型,在两轮试验种分别鉴定有97 和 67个SSR位点与高羊茅耐热性状相关联(P < 0.01)。

  该研究获得国家自然科学基金(Grant #: 31071822; 31470363)和国家“863”项目(Grant #: 2011AA100209-2)的支持。相关研究结果在植物学国际期刊BMC Plant Biology上在线发表(doi:10.1186/s12870-015-0494-5)。

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基于Q ,K ,Q +K 三模型的叶绿素含量、草坪质量和生长速率Quantile-quantile plots 分析

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100份高羊茅种质材料的群体结构分析

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