1970年夏天，第一个限制性内切酶被分离纯化出来，随后在1978年，瑞士和美国的科学家Arber 和Smith因为发现限制性内切酶而获得诺贝尔生理学或医学奖。当七十年代限制性内切酶的应用开始流传开来的时候，以一个叫“蝴蝶”的NE公司为代表的许多国外知名公司就开始寻找更多的限制性内切酶并且将它商业化。
2015年夏天，中国江苏连云港，以中国神话中搬山人物命名的”YG“公司正在尝试研发商业化的限制性内切酶，一年后部分酶研发成功正式上市销售，此时距离NE公司首批内切酶商业化已经过去45年。
1983年春，Mullis发展出聚合酶链式反应（PCR）的概念，并于同年九月用大肠杆菌DNA聚合酶做了第一个PCR实验，只用一个循环。以限制性内切酶为首的基因工程工具酶的发展，极大地促进了生物学的发展，而与PCR技术组合起来后，生物科学家们第一次拥有了强大的武器，去剪切和扩增各种遗传物质，现代分子生物学获得了大发展。因为这个发现，Mullis获得了1993年诺贝尔化学奖。
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