1、什么是质谱分析的三离子原则？
“质谱分析三离子原则”只是对质谱图分析结果解析需遵循的规则的另一种表述方式而已。具体来讲，解质谱图时需遵循以下规则：分子离子峰、重要碎片离子峰（重要低质量碎片离子、特征离子）、亚稳离子（如果有的话，找到母、子离子对，获得母离子与子碎片离子的关系，特别时由分子离子产生的亚稳离子更应引起重视，这对推测结构很重要。）应得到合理的解释，或至少其中大部分峰能得到合理解释，找到其归属。对质谱重要峰指认的完成方说明所推结构是正确的。
2、溶剂残留对质谱有无影响？
溶剂残留对质谱无影响，有的还需要用溶剂做质谱。
3、质谱的EI源温度上升很慢，设定250，仅能升到50。测量HEATER的电阻是18欧，没有烧断。真空度正常，请教是什么原因？
主要可能是两方面的问题：
1.热传感器断了，如果传感器坏了，还可以想办法断掉的脚边用金属丝打个桩，使其导电。
2.加热板坏了，如果加热板坏了，就只有掏钱的份了。
4、氯仿做溶剂可以打ESI谱吗？
用氯仿作溶剂打ESI谱，氯仿对有的质谱仪器的柱子有破坏作用，可以用乙腈或者乙腈加甲醇，乙醇等等。如果在甲醇和乙腈中一点不溶，用DMSO溶解打ESI谱也可以。不过DMSO溶解后，要用甲醇稀释一下以防止DMSO太粘。
5、做质谱前样品要做怎样的预处理？
质谱前的样品最好不含不能挥发物、金属离子、表面活性剂等。关键看会不会影响结晶。象挥发性无机盐必须<20mM，不挥发无机盐必须：<5mM。
6、关于质谱图的问题
不同质谱仪产出的质谱图当然不一样。对于简单的样品，手工算也可以算出质谱图中的序列。
如果谱图质量高，而且已知肽段序列，可以尝试通过峰之间的差值计算氨基酸残基。。
如果质谱图给出的是质核比，那不同的质谱仪可能给出不同结果。如Moldi-tof处理的多肽一般带1个正电，给出的就是近似的多肽分子量。而ESI方法得到的多肽可能带2个以上的正电，给出的就是近似多肽分子量除以所带电荷的数值。图谱不一样是可以理解的，关键是要看看解谱的结果是不是同一个东西。
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