数字PCR技术即Digital PCR技术真正实现了对目标DNA或RNA分子进行绝对定量，在精密度、准确度和灵敏度方面有无与伦比的优势，同时解除了对Ct值和标准品的依赖，提高了抑制剂的耐受能力，因此被称作第三代PCR技术。
Naica crystal
全自动微滴芯片数字PCR仪系统自动化生成25000~30000个微滴2D阵列，将DNA/RNA模板碎金分布在微滴中，达到每个微滴中只含有1个或不含有DNA/RNA模板，自动进入PCR程序，实现核酸的单分子扩增，最后通过对微滴2D阵列进行扫描后，读取阳性微滴数，从而获得目标分子的浓度，还实现了结果的可视化质控。人工操作只需5分钟，2.5小时内即可获得结果，且实现了3个荧光通道检测。
作为灵敏度最高的分子生物学工具，能够准确地区分低于2倍的浓度差异，并提高高背景内源基因中目标分子的分辨能力（如母体DNA为内源基因和胎儿DNA为目标己分子），在如下领域中都有广泛的应用：
肿瘤学研究
肿瘤学研究是数字PCR的重要应用领域，该技术作为极为重要的工具，能够识别DNA突变（例如EGFR）、肿瘤患者用药监控、基因扩增检测、循环肿瘤细胞（CTC）特性研究、长链非编码RNA检测、液体活检中循环的核酸（cfDNA）和肿瘤细胞（CTC）的绝对定量等研究中。
糖尿病
数字PCR技术目前在糖尿病中的研究热点，通过定量检测非甲基化DNA的水平，对I型糖尿病β细胞死亡进行定量，从而监控病情发展。
器官移植监控
为了降低移植物排斥导致的风险，数字PCR技术通过监测受体中移植器官供体的循环DNA水平来检测早期移植排斥。
食品和转基因生物检测
食品行业提供健康安全和优质的产品，并希望能够将这些信息传递给消费者。数字PCR技术能够检测和定量转基因含量、来源于转基因的原料或其他食品中常见的致病微生物，从而确保安全和品质。
产前筛查
目前通过非侵入性产前检测项目（NIPTs）的增加，降低了流产的风险。通过检测循环血液中的胎儿DNA，数字PCR技术作为无风险的胎儿基因分型检测方法，可以检测非整倍体，微缺失，突变等。
肥胖
数字PCR技术能够检测到引起肥胖的重要因素之一AMY1（唾液淀粉酶）的基因拷贝数。
传染性疾病
数字PCR技术可用于检测病毒感染和细菌、HIV病毒潜伏库*监测、残留病毒载量（HIV，肝炎）等。
*病毒潜伏库是指在免疫反应和抗病毒治疗压力下，病毒潜藏的细胞场所或解剖场所。
环境监测
为了增加土壤肥力，农民通常会使用粪便或污水污泥等有机物。为了评估人类及生态系统是否暴露于经土壤传播的病原体和抗生素抗性基因，可以使用数字PCR技术进行检测和精准定量，对于其他类似现象的研究也同样具有应用意义。
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