图 2. 抗体上常见的糖链结构的命名
图 3 显示的是用 250×0.2 mm 内径整体柱分析 20 ng 利妥昔抗体得到的一级质谱图。在 m/z 1800–5000 范围内采集的质谱图显示了大分子蛋白质的典型电荷分布。插图显示的是 m/z 3269 时，放大的最大丰度电荷态（z=+45)，其很好地描绘了完整抗体 4 个丰度最高的糖型。
图 3. 利妥昔抗体的单张全扫描质谱图（10 个microscan），用 250×0.2 mm 内径色谱柱分析 10 ng 利妥昔抗体。插图显示的是放大的最强丰度电荷态(z=+45)，观察到的峰型代表该分子的不同糖型。
通过将完整一级质谱图去卷积，获得了四个最强丰度糖型的完整质量数和一系列较低丰度糖型的质量数（如图 4所示）。根据蛋白序列计算得到的理论分子量并结合图 2中各种预测糖链的结构进行峰归属。
图4. 利妥昔抗体去卷积的质谱图和不同糖型归属（上图），5 个最强丰度糖型的理论质量数和测定质量数的对比（表）
为了获得完整抗体的一级谱图，我们对源内 CID 的设置参数进行了优化。该参数对获得高质量的谱图至关重要。
对于大多数蛋白质来说，源内 CID 一般在 25%-90% 较为适合，对于这个样品来说，最优设置为 80% SID。
图 5. 在不同 SID 设置条件下，1 ng 完整利妥昔抗体的一级质谱图
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