分析测试百科网

搜索

喜欢作者

微信支付微信支付
×

高分辨熔解曲线突变检测

2020.7.13
头像

王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

高分辨熔解曲线(High Resolution Melting)技术是近年来兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在PCR结束后直接运行高分辨熔解,即可完成对样品的分析。该方法与其他遗传分型技术相比具有灵敏度高、特异性好、成本低廉、高通量检测的优点,是进行突变检测的迅速、廉价而有效的方法。

HRM原理

HRM是在PCR基础上通过测定DNA双链熔解曲线变化来检测突变的方法,溶解曲线的变化取决于DNA序列、长度、GC含量,因此,可以通过饱和燃料监控熔解曲线的变化来反映核酸性质的差异,从而对样品进行分析。

在双链体的溶解曲线检测时需要添加合适的染料,饱和染料例如SYBR Green在双链解链过程中会发生重排,无法真实反映DNA熔解情况。不适用于需低温解链的样品而且不能检测异源双链体。因此不能用于熔解曲线的检测。而LC Green是一种与DNA有更强的结合位点,对PCR抑制作用很小的饱和染料,已成功的用于HRM检测中。

HRM操作简便,在PCR结束后添加合适的染料,通过监测升温过程中荧光染料与PCR扩增产物的结合情况来实现的,在升温过程中,双链解开,荧光染料从解链的分子上释放,同时荧光强度降低,所以通过荧光强度和曲线的变化上就可以判断是否存在突变。

20103213555520.jpg

图一:同源双链体和异源双链体的熔解曲线

图二:HRM数据处理过程

HRM的特点和应用

HRM应用:

HRM特点:

HRM:实验设计中需要考虑的问题

总结

HRM灵敏度高、特异性好

该方法是在封闭的试管内进行,可降低污染,因此,该技术具有操作简单、成本低廉、时间少、误差小、高通量检测的优点。是进行突变扫描的首选方法。

 


互联网
仪器推荐
文章推荐