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制备体外剪接反应用HeLa细胞核和胞质S100提取物实验

2020.8.11
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

实验方法原理 胞核提取物可以用于前体 mRNA 的剪接,S100 提取物中虽然包括许多剪接因子,但它不具有剪接活性,因为它只含有剪接所必需的部分 SR 蛋白,不过该提取物中补充一种或多种 SR 蛋白后就可以进行有效的剪接。

实验材料 HeLa 细胞

试剂、试剂盒 DTT苯甲基磺酰氟PBS缓冲液

仪器、耗材 Eagle 悬浮培养基本培养基玻璃勾架器透析袋

实验步骤

―、材料与设备


所有的试剂均需用高质量高压灭菌水配制,例如 Mill Q ( Millipore,Bedford,MA,USA ) 或者双燕馏水。所有用于培养细胞的成分均需高压灭菌,不耐热的材料用 0.22 μm 过滤器过滤除菌。


1. HeLa 细胞悬浮培养


(1) 培养基:Joklik 修改后的 Eagle 悬浮培养基本培养基(ICN Pharmaceuticals 公司),或相当的培养基,这种粉末状的培养基包含除血淸外的所有必须物质。用 Milli Q 水溶解粉末并过滤除菌,配制成 5X 储备液,用过滤除菌水配制工作液并加入小牛血清至 终浓度为 50 ml/L,pH 约 7.0。


(2) HeLa 细胞:用适于在悬浮培养基中生长的细胞株,如 S-3 株。


2. 提取物的制备


试剂 (1) 和 (2) 储存液应保存于 -20℃,在使用前再加入溶液 (3)~(6)。


(1) 1 mol/L DTT。


(2) 20 mg/ml(115 mmol/L ) 苯甲基磺酰氟(PMSF),溶于乙醇。


(3) PBS:137 mmol/L NaCl,2.7 mmol/L KCl,8 mmol/L Na2HPO4,1.5 mmol/L KH2PO4,0.5 mmol/L MgCl2。


(4) 缓冲液 A:10 mmol/L HEPES-KOH ( pH 8.0),10 mmoI/L KCl,1.5 mmol/L MgCl2,1 mmol/L DTT。


(5) 缓冲液 B:0.3 mol/L HEPES-KOH ( pH 8.0 ),1.4 mol/L KCl,30 mmol/L MgCl2。


(6) 缓冲液 C:20 mmol/L HEPES-KOH ( pH 8.0 ),0.6 mol/L KCl,1.5 mmol/L MgCl2,0.2 mmol/L EDTA,25%(V/V)甘油,0.5 mmol/L PMSF,1 mmol/L DTT。


(7) 缓冲液 D:20 mmol/L HEPES-KOH ( pH 8.0 ),100 mmol/L KCl,0.2 mmol/L EDTA,20% ( V/V )甘油,0.5 mmol/L PMSF,1 mmol/L DTT。


(8) 40 ml Dounce 带较松研杵的玻璃勾架器。


(9) 截留分子质量为 12000~14000 Da 的透析袋。


二、操作方法


1. HeLa 细胞悬浮培养


细胞于 37℃ 在转动培养瓶中培养,细胞密度维持在 2X105~5X105。细胞倍增时间大约是 24 h,细胞密度可用血细胞计数器计数。


2. HeLa 细胞核提取物的制备


(1) 取对数生长期(4X105~6X105/ml,不超过 1X106/ml)的 HeLa 细胞用低速离心机在 1800 g 离心 10 min,收集细胞。


(2) 用冰冷的 PBS 轻轻地重悬细胞,再离心,确定细胞沉淀的体积(PCV )。后面所有的步骤都应该在冰上或者在冷室里进行,所有的离心步骤应该在 4℃ 进行。


(3) 将细胞沉淀轻轻地重悬在 5 倍 PCV 的缓冲液 A 中,冰上放置 10 min,使细胞在低渗缓冲液中膨胀。


(4) 于 1800 g 离心 10 min,沉淀细胞。再用 2 倍 PCV 的缓冲液 A 重悬细胞。由于膨胀,细胞沉淀体积会加倍,计算时釆用原来的 PCV。


(5) 用 Dounce 玻璃匀浆器匀浆大约 10 次。细胞裂解的程度通过台盼蓝染色以血细胞计数器检测,目标是 90% 的细胞裂解,但匀浆不要超过必需的次数。注意 HeLa 细胞核很大,并不比完整的细胞小多少。


(6) 裂解液转入高速离心管中,于 1200 g 离心 10 min,用吸管小心取出上清加入一个量筒中以制备 S100 提取物。


(7) 在同一离心管中以 33000 g 离心 20 min,小心吸弃上清。


(8) 12 升 HeLa 细胞培养物获得的浓缩胞核体积(PNV ) 通常为 9~15 ml。加 2 ml 缓冲液 C,旋动以使沉淀与离心管分离,但是不要使沉淀散开,将沉淀和液体转移到带刻度的一次性试管,测量体积,然后减去 2 ml 为估计的 PNV,加入更多缓冲液 C ( 含 0.6 mol/L KCl ) 使 KCl 的终浓度为 0.24 mol/L,其范围应该为 0.20~0.25 mol/L。


(9) 将沉淀和缓冲液(还不要将沉淀重悬,否则溶液将变得黏稠且很难没有损失地转移 ) 转移到一个干净的 40 ml 玻璃 Bounce 匀浆器中,用一个较松的研杵匀浆几次使之悬浮。匀浆 10 次应该足以制备匀质的悬液。


(10) 将匀浆转移到一个或多个带螺帽的高速离心试管中并轻轻晃动混合 30~45 min。


(11) 高速离心(约 33000 g,30 min)沉淀盐洗过的细胞核,并小心地将上清转移到一次性试管中,避免沉淀的污染。


(12) 用缓冲液 D 透析上淸两次(通常用 1~2 L)。一次过夜,另一次至少 4 h。


(13) 33000 g 高速离心 20 min,去除透析过程中形成的沉淀,并小心地将上清(核提取物)转移到一次性试管中。


(14) 将提取物以 0.1~1 ml 分装到微量离心管中。将离心管放入液氮中快速冷冻,于 -70°C 或更低温度储存。


3. HeLa 细胞胞质 S100 提取物的制备


在等待操作1 "HeLa 细胞核提取物的制备" 中的步骤 (7) 的离心时,将第 (6) 步得到的上清进步处理可获得 S100 提取物,它包括胞质成分和许多(但非全部)核成分,它在低渗缓冲溶液 A 中提取。


(1) 测量上请液的体积,加 0.11 倍体积的缓冲液 B,轻轻混合。


(2) 在超速离心管中以 100000 g 离心 1 h。


(3) 将上清转入一次性试管中。


(4) 用缓冲液 D 透析 2 次,一次过夜,另一次至少 4 h。提取物的体积在透析期间显著缩小,这是因为缓冲液 D 中含有的甘油使提取物浓缩。


(5) 33000 g 高速离心 20 min 去除不溶物质。


(6) 将提取物以 0.1~1 ml 分装到微量离心管中,快速冷冻并如操作3 “HeLa 细胞核提取物的制备” 中的步骤 (14) 所述储存。12 升培养物可制备胞质 S100 提取物 40~55 ml,总蛋白浓度为 10~15 mg/ml 提取物活性可保持数年之久。


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