（二）植物病原菌的分离
1．叶斑类和枝杆病斑类（非维管束侵染）病原菌分离
首先选择具有典型症状的新鲜病叶作为分离材料，按下述步骤操作：
①培养基平板制备：将PDA培养基在微波炉中加热熔化验，以无菌操作法将溶化过的培养基倾注入灭过菌的培养基中，每皿经12毫升，可形成2-3毫米厚的平板。（为防止细菌污染，倒碟前给每三角瓶内加6%乳酸4-6滴）。
②病叶或病枝经自来水冲洗，从病斑周转1-2毫米处的健组织部位剪下（若为枝干，则将带有病斑的皮层剥下，但）。
③取10毫升小烧杯经酒带消毒，放入分离材料，倒入0.1%升汞液适量作表面消毒一分钟，或用1%漂白粉消毒均可。
④消毒后倾出消毒液，用无菌水冲洗2——3，最后一次无菌水不要倒掉。
⑤用灭菌镊，剪在无菌水中将分离材料剪成2——3毫米大小的方块，每块组织均应为病健相间组织。用灭菌镊子夹取剪好的材料，放入培养基平板上，轻轻按压。每皿4——5块，排放均匀。
⑥用蜡笔在培养皿上注明分离代号，日期、姓名，将培养皿翻转放置于23—25℃
⑦3-4日后挑选由分离材料上长出的典型而无杂菌的菌落，在菌落边缘用移菌针挑取带有菌丝的培养基一小块，转入试管斜面培养基中央，于25℃温箱中培养。
2．种子内病菌的分离
将整粒种子或种子的一部分进行冲洗，再经表面消毒（升汞或漂白粉），最后用灭菌水洗涤后移到人工培养基平板上培养（或者直接放在皿内保湿培养于25℃温箱中）。
3．危害输导组织病原的分离（以枯萎病为代表）
先将分离茎作表面消毒，然后用灭菌刀剥去表皮，剪取其中小块变色的维管束组织，再用漂白粉进行表现消毒后，移于培养基平面上培养。
4．分离物的纯化
前述方法获得分离物，必须经过纯化，才能成为培养，纯化的方法有单孢子分离法和边续稀释培养法两种，后者简便，为了一般研究所常用。
连续稀释法：对真菌材料来说，就是从典型菌落边缘切取含有菌丝的培养基一小块，移植于另一培养基平板上，待菌落形成后，再依此法移植。如此数次，直至菌落形态典型，无杂菌时即可移入斜面试管中培养保存。
附：
1、0.1%升汞液的配制：升汞1克，浓盐酸2.5毫升；加水1000毫升。注意要先将升汞用盐酸溶解，然后加水稀释。
2、P.D.A培养基成分；马铃薯200克，葡萄糖10-20克，洋菜17-20克，水1000毫升。
3、水洋菜培养基成分，洋菜17-20克，水1000毫升。
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