分析测试百科网

搜索

喜欢作者

微信支付微信支付
×

蛋白质组样品制备程序-2

2020.9.01
头像

王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

2)在4℃条件下以20000g的离心力冷冻离心60分钟 (离心力务必达到或大于20000g)。

3)移取上清溶液。若上清样品不立即使用,则须储存于-80℃(最佳条件)或-20℃的无霜冰箱中以防止蛋白质的降解。

2、用初始缓冲液(Start buffer)交换处理细胞裂解液

1)在上述细胞裂解液中,加入初始缓冲液至最后体积为2.5mL,充分混合。

2)用约25mL初始缓冲液平衡PD-10柱(编号:17-0851-01)。

3)加入步骤第1)所获得的2.5mL样品到PD-10柱, 丢弃洗脱液。

4)用初始缓冲液洗脱, 从PD-10柱中洗脱蛋白质,收集前3.5mL部分。

5)所获得的3.5mL样品即可用于HPCF 1D柱的进样分离分析。

* 为检验所获得样品的优劣,可取50uL上述已经交换过的样品进样到HPRP 2D柱,观察所有蛋白的反相洗脱色图谱。在这一步,如果样品制备有一些问题, 在分析色谱图后将会鉴别出来。注意: 根据化合物和蛋白的量预测样品, 在这时应该得到一张“豪猪”状的色谱图(a very "spikey or porcupine" liking chromatogram),使你分析的样品有意义,如果没有这样的蛋白图谱, 请停止进行色谱聚焦分离分析,继续摸索样品的制备方法。

四、膜蛋白裂解方法步骤

1、膜蛋白裂解缓冲液的组份及其终浓度

尿素5M

硫脲2M

甘油10%

Tris-HCl50mM (pH 7.8-8.2, 10-25℃)

n-辛基葡糖苷2.0%

SB3-10(N-decyl-N,N-dimethyl-3-ammonio-1-propane sulfonate) 2.5%(w/v)

TCEP (Tris (2-carboxyethyl)phosphine hydrochloride) 5 mM

蛋白酶抑制剂 1.0mM

2、10%甘油溶液(100mL)的配制

1)量取1mL甘油到100mL的量筒;

2)加蒸馏水至指定刻度(100mL)。

3、31.45mM蛋白酶抑制剂溶液(母液)(10mL)的配置

1) 在P/N P2714蛋白酶抑制剂中加入10.0 mL的水,混匀。

2) 分装到2mL的小瓶中,放置在-20℃保存备用。
4、裂解缓冲液储备液(50mL)的配制

1)取10% 的甘油溶液20 mL 放在100 mL的烧杯中;

2)加入Tris0.304 g (Fisher, Part Number: BP154-1),搅拌至完全溶解(50Mm);

3)慢慢加入硫脲7.61 g (Sigma, Part Number: T7875, FW 76.12), 搅拌至完全溶解;



4)慢慢加入15.02 g尿素(Sigma, Part Number: U0631, FW 60.06) , 搅拌至完全溶解;

5)慢慢加入1.0 g n-辛基葡糖苷(Sigma, Part Number: O8001, FW 292.4), 搅拌至完全溶解;

6)慢慢加入1.25 g SB3-10 (Sigma Part number: D4266, FW 307.5) , 搅拌至完全溶解;

7)慢慢加入0.072 g TCEP (Sigma, Part Number: C4706, FW 286.7), 搅拌至完全溶解;

8)加入31.45mM蛋白酶抑制剂溶液1.6mL, 搅拌至完全溶解;

9)转移到50mL的量杯中, 加10%甘油溶液至50mL容量;

10)分装到2.0 mL的小瓶中, 在-20℃中保存备用。

5、膜蛋白裂解方法步骤

1)取以上的裂解缓冲液2.0 mL悬浮细胞膜样品, 充分振荡混合。

2)在4条件下离心力20000g下冷冻离心60分钟(离心力务必大于或

等于20000g)。

3)移取上清液。若上清液样品不立即使用,则须储存于-80℃(最佳条件)或-20℃的无霜冰箱中以防止蛋白质的降解。

6、用初始缓冲液(Start buffer)交换处理细胞裂解液

1)在上述细胞裂解液中,加入初始缓冲液至最后体积为2.5mL,充分混合。

2)用约25mL初始缓冲液平衡PD-10柱(编号:17-0851-01)。

3)加入步骤第1)所获得的2.5mL样品到PD-10柱, 丢弃洗脱液。

4)用初始缓冲液洗脱, 从PD-10柱中洗脱蛋白质,收集前3.5mL部分。

5)所获得的3.5mL样品即可用于HPCF 1D柱的进样分离分析阶段。

*为检验所获得样品的优劣,可取50uL上述已经交换过的样品进样到HPRP 2D柱,观察所有蛋白的反相分离图谱。在这一步,如果样品制备有一些问题, 在分析谱图后将会鉴别出来。注意:根据化合物和蛋白的量预测样品,在这时应该得到一张“豪猪”状的色谱图(a very "spikey or porcupine" liking chromatogram),使你分析的样品有意义, 如果没有得到这样的蛋白图谱,请停止进行色谱聚焦分离分析, 继续摸索样品制备步骤和方法。


互联网
文章推荐