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Northern杂交试验指导手册(5)

2020.9.07
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

 E.杂交

建议杂交条件:探针浓度50~100ng/ml,温度68℃过夜。
1.将印迹膜置于装有预杂交液的杂交袋中(每100cm2膜20ml预杂交液),封好杂交袋,在设定的杂交温度下预杂交至少1小时。
2.将探针在沸水浴中变性10min.(探针一经变性,立即使用),用预杂交液稀释成设定浓度。
3.将杂交袋中预杂交液弃去,加入稀释好的含有探针的杂交液,在设定杂交温度条件下(68℃)杂交过夜。
4.杂交完成后,将杂交液回收置于一可耐低温又可沸水浴的试管中,贮存于-70℃以备重复使用。重复使用时,解冻并在68℃下变性10min.。
5.洗膜:杂交膜取出后用2×洗膜缓冲液室温下洗膜2次,每次15min.,除去非结合探针以减少背景。接下来用0.5×洗膜缓冲液洗膜2次,每次15min.,洗膜温度42℃,然后再在0.1×洗膜缓冲液中洗膜2次,每次15min.,洗膜温度 68℃。当探针长度小于100bp时,最后一次的洗膜温度要经过预备试验确定。
七、杂交结果检测

方法一、化学发光检测

试剂及其配制:
洗膜缓冲液:100mmol Maleic acid
150mmol NaCl
0.3%(v/v) Tween20
pH 7.5
Maleic acid缓冲液:100mmol Maleic acid
150mmol NaCl
pH 7.5
封闭液:5% (w/v) SDS
17mmol/L Na2HPO4
8mmol/L NaH2PO4
室温保存,如果需要,用0.45μm的滤膜过滤除菌。
检测缓冲液:100mmol Tris-HCl(pH 9.5)
100mmol NaCl
TE缓冲液:10mmol Tris-Cl (pH 8.0)
1mmol EDTA
Anti-DIG-AP
CSPD: 25mmol CSPD(用前稀释)

检测程序:
1.杂交洗膜后,将膜置于洗膜缓冲液中平衡1min.。
2. 将化学发光底物置于室温下。
3.用一个干净的盘子或袋子将膜在封闭液中封闭30~60min.(封闭过程在摇床上轻轻摇动),在封闭快结束时,按下列方法准备抗体溶液。
4.在第一次使用时,Anti-Dig-AP 在13000rpm.下离心5imin.除去小的凝聚体,以免造成背景过高,以后使用前只需离心1min.。离心后将Anti-Dig-AP用封闭液稀释 (1∶10000),3μl Anti-Dig-AP加入30ml封闭液混匀。
5.在封闭完成后倒出封闭液,加入稀释好的抗体溶液,浸膜至少 30min.。
6.去除抗体溶液,用洗膜缓冲液缓慢洗膜2次,每次15min.。
7.去除洗膜缓冲液,在检测液中平衡膜2次,每次 2min.。注意:在使用化学发光底物处理之前,膜必须保持湿润,哪怕是轻微的干燥也会产生很高的背景。
8.用检测缓冲液稀释 CSPD(1∶100),选择以下方法的一种进行发光底物处理:
a. 单张杂交膜处理:将膜置于一保鲜袋中或两张醋酸纸之间,用镊子轻轻抬起一角,用一消毒的吸管从膜顶端加入0.5ml(0.5ml/100cm2) 化学发光底物,让底物溶液均匀扩散到膜的表面,然后将膜放平,用一张湿润的滤纸轻轻排除气泡使膜四周被液体封闭,室温下放置5min.,然后接步骤9。
b. 成批膜处理:取一个干净的盘子,用消毒吸管取5~10ml底物溶液于盘中,用一钝头镊子将膜置于其中,轻轻倾斜盘子直到膜表面全部浸有底物溶液,室温下放置5min.,用镊子小心夹住膜的一角,提起使多余液体滴出(切勿使膜干燥),然后将其置于一干净保鲜袋中。重复以上过程将膜一张一张全部处理完后接步骤 9。


9.当膜半干燥时,即刻将膜封闭在保鲜袋中。为了缩短曝光时间,膜需在室温下稳定7~8小时或37℃下15min.,达到稳定态的膜单拷贝基因的检测也只需曝光15min.,如果封膜后马上曝光处理,则曝光时间要60min.。

方法二、NBT-BCIP荧光检测

试剂:Anti-Dig-AP
NBT
BCIP
其它同化学发光检测。

试验程序:
1.杂交洗膜后,将膜置于洗膜缓冲液中平衡1min.。
2.将化学发光底物置于室温下。
3.用一个干净的盘子或袋子将膜在封闭液中封闭30~60min.(封闭过程在摇床上轻轻摇动),在封闭快结束时,按下列方法准备抗体溶液。
4.在第一次使用时,Anti-Dig-AP 在13000rpm.下离心5imin.除去小的凝聚体,以免造成背景过高,以后使用前只需离心1min.。离心后将Anti-Dig-AP用封闭液稀释 (1∶5000),6μl Anti-Dig-AP加入30ml封闭液混匀。


5.在封闭完成后倒出封闭液,加入稀释好的抗体溶液,浸膜至少 30min.。如果是在保鲜袋中处理,要排除气泡;如果在盘子中进行处理,要轻轻摇动,使膜全部浸入抗体溶液中。
6.去除抗体溶液,用洗膜缓冲液缓慢洗膜2次,每次15min.以除去非结合抗体。
7.与此同时,准备颜色底物溶液,在10ml检测缓冲液中混合45μl NBT和35μl BCIP,注意避免直接暴露在光下。
8.去除洗膜缓冲液,在检测液中平衡膜2次,每次2min.。
9.除去检测缓冲液,加入大约10ml 颜色底物溶液,显色反应可以在保鲜袋中进行,也可以在暗盒中进行,显色反应中切勿摇动。在显色反应中,可以短时暴露于光下观察,一般几分钟后开始显色,但完全反应大约需要12小时。
10.显色完成后,用H2O洗膜以终止反应,如果膜还要再用则用TE终止反应。
结果记录可采用影印和照相的方法,膜如果贮存在TE中可长期保存颜色不变。


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