一般来说，对于以产甲烷为主要目的的厌氧过程要求pH值在6.5~8.0之间，废水碱度偏低或运行负荷过高时，会引起反应器内挥发酸积累，导致产甲烷菌活力丧失而产酸菌大量繁殖，持续过久时，会导致产甲烷菌活力丧失殆尽而产乙酸菌大量繁殖，引起反应器系统的“酸化”。严重酸化发生后，反应器难以恢复至原有状态。
厌氧消化作用失去平衡时会显示出如下“症状”：①沼气产量下降；②沼气中甲烷含量降低；③消化液VFA增高；④有机物去除率下降；⑤消化液pH值下降；⑥碳酸盐碱度与总碱度之间的差值明显增加；⑦洗出的颗粒污泥颜色变浅没有光泽；⑧反应器出水产生明显异味；⑨ORP(氧化还原电位)值上升等。
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