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最杰出的等温扩增方法之一——解旋酶依赖性扩增HDA

2021.6.29
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

解旋酶依赖性扩增技术(helicase-dependent amplification,HDA)于2004年发明,是模拟动物体内DNA的复制机制的一种体外恒温基因扩增技术。随着技术的发展,在反应速度、特异性和灵敏度上也不断被提升,至少有三代HAD技术,整个系统比较简单,高效。

 

系统核心组成:

 

表:三代HAD核心蛋白原料的异同点

反应系统

第一代

中温(mHDA)

第二代

热稳(tHDA)

第三代

热稳(tHDA)

解旋酶

UvrD

Tte-UvrD

Helimerase

SSB

SSB

SSB

SSB

DNA聚合酶

Klenow

Bst

Helimerase

其他

需要MutL

不需要

不需要

反应温度

37℃

65℃

65℃

 

反应原理:

1、(MutL辅助)解旋酶将双链核酸解旋,产生部分单链的序列;

2、SSB动态平衡结合到新形成的单链上,引物与单链区结合;

3、在DNA聚合酶的作用下形成新的双链DNA。

 

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HAD的原理图


系统继续提升空间:

1、筛选高效解旋酶

HAD扩增方法受DNA解旋酶解旋速度和延伸长度的影响很大,所以筛选更高效的解旋酶会更大程度的缩短反应时间;

2、解旋酶和聚合酶协同工作

开发或者寻找自然界中协同工作的解旋酶和聚合酶,尽可能平衡解旋酶和聚合酶的反应速度,防止解旋酶取代聚合酶。因为解旋酶解链反应是反应系统的限速步骤,所以要确保一旦解链,尽可能有效的完成新链的合成。


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