活化的目的是创造一个与样品溶剂相容的环境并去除柱内所有杂质。
通常需要两种溶剂来完成上述任务，个溶剂（初溶剂）用于净化固定相，另一个溶剂（终溶剂）用于建立一个合适的固定相环境使样品分析物得到适当的保留。每一活化溶剂用量约为1-2ml/100mg固定相。终溶剂不应强于样品溶剂，若使用太强的溶剂，将降低回收率。
通常采用一个弱于样品溶液的溶剂不会有什么问题。值得注意的是，在活化的过程中和结束时，固定相都不能抽干，因为这将导致填料床出现裂缝，从而得到低的回收率和重现
性，样品也没得到应有的净化。如果在活化步骤中出现干裂，所有活化步骤都得重复。
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