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血清学方法具有三方面的局限性:
第一,由于抗原抗体反应的专一性,每种转基因产品都需要开发和建立专门的检测试剂和方法,而转基因产品种类众多,要建立全部转基因产品血清学检测方法具有一定的难度。
第二,由于血清学方法检测的对象是蛋白质,对于加工过的转基因食品中的蛋白质抗原性很容易破坏,从而影响检测结果的准确性;
第三,有些转基因产品外来插入基因基本就不表达出蛋白质,或者表达量很低,或者表达量变化很大,从而无法用此法检测。