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天然培养基是指一类利用动物、植物或微生物体包括其提取物制成的培养基。
例如。牛肉膏蛋白胨培养基、麦芽汁培养基和LB培养基等。
常用的天然有机营养物质包括豆芽汁、玉米粉、土壤浸液、麸皮、牛奶、血清、椰子汁等。天然培养基成本较低，除在实验室经常使用外，也适于用来进行工业上大规模的微生物发酵生产。
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