冻干机全称真空冷冻干燥机，按系统划分，主要由真空系统、制冷系统、循环系统（加热系统）和控制系统等四个主要部分组成。
根据用途划分，冻干机分为制药型冻干机和食品级冻干机，因此细分下，冻干机八大系统主要由制冷系统、真空系统、循环系统、控制系统、液压系统、清洗系统、灭菌系统、化霜系统等组成。其中sip灭菌系统、cip清洗系统、液压系统多用于制药型冻干机。
1、制冷系统 由冷冻机与冻干箱内部的管道组成。冷冻机的功用是对冻干箱和冷凝器进行制冷, 以产生和维持它们工作时所需要的低温。
2、真空系统对冻干箱体及冷阱抽真空。主要由冻干箱、冷凝器、管道和阀门、真空仪表和真空泵构成。
3、循环系统（加热系统）为搁板提供冷热源。由一系列冷却和加热换热器组成，导热介质由循环泵提供动力，部件通过AISI304不锈钢管道连接，导热介质通过搁板与产品间实现热交换。
4、控制系统控制冻干机运行及工艺设定。所有需要控制和调节的仪器都安装在两个各自独立的柜子中：电气柜用于电气系统，控制柜用于仪表和控制系统。
5、液压系统主要用在冻干结束时将瓶塞压入瓶口，例如西林瓶药品冻干粉。
6、清洗系统在线清洗系统(CIP)用于冻干箱及冷阱在冻干结束后的清洗。
7、灭菌系统在线灭菌系统（SIP）用于冻干箱及冷阱冻干操作前后的灭菌。
8、化霜系统冻干结束，对捕水阱进行化霜，才可以进行下一次冻干操作。常见化霜方式分为蒸汽化霜和水浴化霜两种。
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