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用琼脂糖作支持介质。另外,实验室常用的核酸染色剂是溴化乙锭(EB)。
要注意观察凝胶时应根据染料不同使用合适的光源和激发波长,如果激发波长不对,条带则不易观察,出现条带模糊的现象。其好处是染色效果好,操作方便,但是稳定性差,具有毒性。
一般的核酸检测只需要琼脂糖凝胶电泳就可以;如果需要分辨率高的电泳,特别是只有几个bp的差别应该选择聚丙烯酰胺凝胶电泳;用普通电泳不合适的巨大DNA链应该使用脉冲凝胶电泳。