纳豆激酶的一个显著功能便是具有溶解血栓的作用．MimuguF等人用血凝块溶解分析法涮定了纳豆激酶的纤溶活性，将之同Plasmin比较，发现纳豆激酶的纤溶活性是Plasmin的4倍；MiLsugu．F。将纳豆激酶通过静脉注射到经化学诱导合成的血栓模型时，发现有明显的血栓溶解，并且显示出比纤溶酶和弹性蛋白酶更高的纤溶能力。
上述研究表明纳豆激酶无论是在体外还是在体内，都表现出强的纤溶活性纳豆激酶同时可激活体内的纤维蛋白溶酶原，从而使内源性纤溶酶的量有所增加。另外．健康人口服纳豆激酶之后，出现以下效果：
①明显地缩短了尤球蛋白的溶解时间(ELT)；
②血浆中的纤溶活性提高；
③血浆中t-PA量有所增加。由于NK的安全性，稳定性和良好的溶解血栓的作用，其有可能作为口服试剂用于血栓治疗。
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