耐药性可分为固有耐药（intrinsic resistance）和获得性耐药（acquired resistance）。
①固有耐药性又称天然耐药性，是由于细菌结构与化学组成的不同，本身对抗菌药物不敏感，如链球菌对氨基糖苷类抗生素天然耐药，天然耐药性是由细菌染色体基因决定，代代相传，不会改变。
②获得性耐药性是由于细菌与抗菌药物接触后，由质粒介导，通过改变自身的代谢途径，使其不被抗菌药物杀灭。如金黄色葡萄球菌与淋球菌产生β-内酰胺酶而对β-内酰胺类抗生素耐药。获得性耐药性可由质粒将耐药基因转移给染色体而遗传后代，成为固有耐药性，也可因不再接触抗菌药物而消失。
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