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杯状细胞散布在器官的上皮层中，如肠道和呼吸道。它们存在于气管、支气管和呼吸道的较大细支气管、小肠、大肠和上眼睑的结膜中。在结膜中，杯状细胞是泪液中粘蛋白的来源，它们还会将不同类型的粘蛋白分泌到眼表。在里面泪腺，粘液是由腺泡细胞合成的。
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