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科学家尚未就成体干细胞的鉴定标准达成一致，然而，经常被采用的鉴定方法包括：
1)利用分子标记在活体组织中对细胞进行标记，然后确定它们所产生的特定细胞类型。
2)将细胞从活体动物上分离出来，在对其进行细胞培养的过程中进行标记，之后将细胞移植入另一个动物体内，观察该细胞是否可以再生其来源组织。
3)分离细胞，进行细胞培养，并对其分化进行控制，通常采用加入生长因子或向细胞内引入新基因的方法，进而观察细胞的分化方向。
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