编辑一般发生在mRNA的3’端而不在5’端，1988年Kenneth等首次报道了编辑在3'端的现象。他们合成了2种编辑引物和2种未编辑引物。完全编辑的成熟RNA仅能同编辑引物杂交，用PCR检测到了杂交带，它不能杂交到未编辑mRNA上。相反，未编辑RNA仅能同未编辑引物反应。如果编辑是从转录物的3’端开始按3'→5’方向进行，那么3’端编辑的转录物将可以被测定出来。在PCR扩增时，只有3’端引物是被编辑的才有杂交反应，而5’端被编辑的引物不能扩增，试验结果说明了编辑是按mRNA的3’→5’方向进行的。
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