1986年Kinashi获得IL-5cDNA克隆。小鼠IL-5由133氨基酸残基组成，含21氨基酸的信号肽，成熟IL-5分子含有112氨基酸残基，裸肽分子量12～15kDa，有3个糖基化位点，糖基化后分子量为18kDa，糖基化对于IL-5活性表达以及与相应受体的结合起重要作用。小鼠IL-5通常以二硫键连接的二聚体形式存在，分子量为45kDa。人的IL-5由134氨基酸残基组成，含22氨基酸残基信号肽，2个糖基化点，人和小鼠IL-5基因分别定位于第5号和第11号染色体，与IL-3、IL-4、GM-CSF等造血因子的基因密切连锁。人和鼠IL-5在氨基酸水平上有70%的同源性，生物学作用有交叉反应。
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