避免腐蚀性液体接触样品槽，以免样品槽表面被腐蚀，造成样品加热不均匀。
避免PCR仪与冰箱等大功率仪器共用一个电源接口，大功率仪器的电流波动会导致PCR仪的运行不稳定，甚至重启。若是定量PCR仪，会影响收集到的荧光信号强度，造成扩增曲线的波动。
仪器在运行过程中，禁止强行切断电源来结束程序（突遇停电等意外除外），因为电源切断后，风扇强制停止，导致仪器内部元器件散热不顺畅，影响元器件使用寿命。
如果发现仪器降温速度明显比正常状态的慢，仪器发烫，或者温度下降达不到设定的温度，请检查进风口和出风口是否有异物堵塞。
若采用PCR单管做实验而且样品量比较少时，为保证热盖平整压在所有样品管上，建议在样品槽四个角放置4个同类型的空管。
PCR反应最后一步请务必设置为：16℃，2 min。（切忌4℃，∞，避免压缩机过度耗损）。
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