目前已经筛选和分离到很多能降解角蛋白的细菌，主要为芽孢杆菌。Williamsh等（1989）由家禽羽毛发酵液中富集、分离到了羽毛分解菌，经鉴定为嗜热型地衣芽孢杆菌（Bacillus licheniformis），这种菌在以羽毛作为其主要的碳氮源的培养基条件下生长最适宜，但不能降解未经高温蒸煮的羽毛。其他芽孢杆菌包括嗜碱芽孢杆菌（Bacillus pseudofirmus）、枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）、短小芽孢杆菌（Bacillus pumilus）等。另外具有角蛋白酶活性的细菌还有嗜热厌氧菌、弧菌科细菌（Vibrionaceae）、海岛闪光杆菌、金黄杆菌属等。
细菌生长快、易于繁殖、产酶活性高，角蛋白酶最适温度、pH值等性质特异，具有良好的应用潜力。
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