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SRP既能识别露出核糖体之外的信号肽并与之结合，又能识别内质网膜上的SRP受体。
通常SRP与核糖体的亲和力较低，但当游离核糖体合成信号肽后，它便增加了与核糖体的亲和力，并与之结合形成SRP-核糖体复合体，由于SRP占据了核糖体的A位点，使蛋白质合成暂时终止。
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