1、意识障碍
维持意识清醒主要依靠觉醒反应和认知反应。觉醒状态主要由上行网状激活系统来维持，因而脑干网状结构病变可丧失睡眠觉醒周期的反应，导致意识丧失。
2、幻觉
按幻觉的责任病灶可分为皮层感觉中枢性幻觉、颞叶性幻觉和脑干性幻觉3种。脑干性幻觉的概念是Lhermitte（1992）首先提出中脑、桥脑被盖部病变导致梦幻状态的报告，以后Van Bogaert报告表现同样状态的梅素性脑动脉炎剖检病例命名为脑脚幻觉症。其特征为：⑴以实体性、感觉性明显的动物、人物、情景等幻觉为主体，可伴有动作的幻觉；⑵多发生于黄昏时间；⑶对幻觉保有批判能力；⑷伴有睡眠周期异常，脑脚幻觉的责任病灶可为中脑、桥脑甚至延髓，病变位于脑干背侧上行性网状激活系统的广泛区域。
3、眩晕
眩晕可分为旋转性眩晕（vertigo）、动摇性眩晕（dizziness）和振动幻觉（oscillopsia），脑干网状结构与小脑有纤维联系，与眼球运动相关，也与前庭系有间接联系，脑干网状结构所致眩晕的动摇性眩晕较旋转性眩晕多见。也可能出现视性眩晕（振动幻觉）。
4、眼球运动障碍
桥脑旁正中网状结构为脑干侧视中枢，中脑网状结构内有脑干垂直眼球运动中枢，因而脑干网状结构病变时可出现各种眼球运动障碍，包括同向侧视麻痹、核间性眼肌麻痹、Foville征状群、Millard-Gubler症群、一个半征候群和Parinoud症候群等。
5、循环功能障碍
延髓病变可致急性神经原性高血压，实验证实，孤束核和尾侧延髓腹外侧部限局性障碍可导致急性神经源性高血压。临床观察证实，延髓受压、缺血可引起急性神经源性高血压。其机制可能为：⑴调压反射障碍；⑵从丘脑下部到脑干的下行经路被激活或抑制；⑶由于缺血导致延髓交感神经系直接受刺激，包括孤束核在内的延髓病变时由于压力感受反射障碍可致心跳、血压波动，发生急骤血压增高。
6、呼吸功能障碍
在延髓有控制呼吸的呼吸中枢，控制呼吸节律，此外尚有高位中枢，来自末梢的神经性调节以及血中化学物质等构成复杂的呼吸调节机制，延髓吸气中枢位于延髓网状结构的腹内侧，下橄榄核上方4/5处散在分布，吸气中枢对脊髓吸气神经元和膈肌神经元有兴奋作用，而对脊髓呼气神经元有抑制作用。呼气中枢位于其背外侧，对脊髓呼气神经元有兴奋作用而对脊髓吸气神经元有抑制作用。吸气、呼气中枢之间有中间神经元，对其兴奋、抑制有调节作用。
7、呃逆
呃逆为膈肌阵挛，认为是由于呼吸中枢附近机能异常所致，除胃等消化道及胸腔脏器的反射性因素外，下部脑干的血管病变常可出现，有时可合并软腭肌阵挛。
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