利用某种化学药品与膜面有害物质进行化学或溶解作用来达到清洗的目的。
1、酸洗法：常用的酸有盐酸、草酸、柠檬酸等。配制后溶液的PH值因材质类型而定。例如CA膜清洗液PH=3～4，其他PS、SPS、PAN、PVDF等膜PH=1～2。利用水泵循环操作或者浸泡0.5～1h，对去除无机杂质效果好;
2、碱洗法：常用的碱主要有氢氧化钠、氢氧化钾和碳酸钠等。配制碱溶液的PH 值也因膜材质类型而定，除CA膜要求PH=8左右以外，其他耐腐蚀PH=12，同样利用水泵循环操作或者浸泡0.5～1h，对去除有机杂质及油脂有效;
3、氧化性清洗剂：利用1～3%H2O2，500～1000mg/LNaClO 等水溶液清洗超滤膜，既去除了污垢，又杀灭了细菌。H2O2 和NaClO是常用的杀菌剂。
4、加酶洗涤剂清洗：加酶洗涤如0.5%～1.5%胃蛋白酶、胰蛋白酶。对去除蛋白质、多糖、油脂污染物质有效 。
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