染色体转化过程包括有转化能力的染色体DNA片段的吸附、吸收和整合3个阶段。外源DNA首先吸附在细菌细胞表面的一些接受位点上。肺炎双球菌和枯草杆菌等细胞的接受位点没有专一性，它们能吸附同种的DNA，也能吸附大肠杆菌的DNA。流感嗜血杆菌的接受位点则只能吸附近缘细菌的DNA。DNA在和细菌刚接触时可以被洗去，在稳定吸附以后便不能洗去，但还能被核酸酶水解。
DNA被细胞吸收以后便不能被外源的核酸酶水解。能吸附的DNA主要是双链状态的，在通过细胞膜进入细胞的吸收过程中DNA分子转变为单链，并以这种形式整合到细菌染色体上。整合过程又可以分5个步骤。
外源基因整合后，通过基因表达使受体细菌的表型发生相应的变化。转化模式至少对于肺炎双球菌和枯草杆菌来讲是正确的。
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