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如果是单酶切，超螺旋质粒会变成开链DNA，开链的DNA在凝胶中泳动速度慢于超螺旋质粒，因此条带会偏大，这是酶切充分的情况。如果不充分，就会有大小有差距的几条带；
如果是双酶切，而且片段大小适中，可以看见酶切的片段和载体，还有未切开的质粒。
能不能区分超螺旋质粒和开链质粒，和所用琼脂糖凝胶的浓度，电泳时间，DNA纯度有关。试着延长跑胶的时间，应当是有区别的。酶切之前就有几条带，可能是因为质粒样品中有杂带，来源于杂菌或者降解。
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