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根据孢子的形态、大小和遗传特点，孢子可分同形孢子与异形孢子两种类型。
同形孢子只有一种类型的孢子，它们的原叶体是雌雄同株的。但异形孢子则有大小不同和雌雄分化的二形孢子，它们的原叶体一般是雌雄异株的。在蕨类植物的卷柏属已有异形孢子的分化；水韮属、蘋属、槐叶蘋属和满江红属等也具异形孢子。裸子植物和被子植物则完全为异性孢子。
孢子的颜色和外壁层次也随种类而异。有的孢子具有三层壁；有的孢子壁分为二部分。
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